Hasta el 16 de diciembre de 2006, la estación contaba con la conexión directa con Algeciras mediante el tren «Estrella del Estrecho» y hasta 2001 con Granada/Almería a través del tren «Estrella Sierra Nevada».
Con el declive y posterior supresión de estos servicios, que hacían parada en la estación de madrugada, la estación quedó únicamente servida por Regionales Exprés (antes «Lince») que hacen el trayecto Madrid-Chamartin a Jaén y viceversa.
Estas últimas vías se hallan al sur de la estación.
Estas vías y la tercera situada en frente del edificio de viajeros (sin acceso a andén) son muy poco utilizadas.
Todos los servicios son prestados por trenes MD de Renfe.