Debe su nombre al máximo héroe naval chileno Arturo Prat Chacón.Esta nueva denominación coincidió con el llamado Curso de los Héroes, del que fueron parte Arturo Prat Chacón, Luis Uribe Orrego, Carlos Condell de la Haza, Jorge Montt Álvarez y Juan José Latorre, entre otros.Al término del segundo año, los cadetes obtendrán el grado académico de bachiller y al finalizar el cuarto año reciben el grado académico de licenciado en ciencias navales.En esta condición, son contratados por la Armada, siendo transbordados al buque escuela Esmeralda para realizar su crucero de instrucción.En esta unidad, los jóvenes oficiales realizan una etapa de formación práctica aplicada.
