Este ordenó reprimir las protestas disparando con ametralladoras contra los trabajadores y sus familiares concentrados en el recinto de la escuela.

Las tropas acabaron con la vida de los trabajadores junto con sus familias y dieron un trato especialmente duro a los sobrevivientes.

Se estima que murieron entre 2200 a 3600 personas[3]​[4]​[5]​ Pese a lo anterior, sea cual fuera el número, al decir del historiador Gonzalo Vial Correa y otros, «nadie duda de la singular magnitud de la matanza».

Debido a esto, se construyó un nuevo edificio para la escuela, de estilo art-deco, que fue inaugurado en 1936.

La polémica demolición se realizó para levantar en su lugar un edificio cuya fachada recrea la arquitectura de madera del Iquique de la época del salitre, lo que se conoce como un «falso histórico».