Realizó estudios superiores en la Universidad Johns Hopkins de los Estados Unidos y posteriormente estudió finanzas y minería en París, Francia.

En 1912, junto con Agustín Vales Castillo, fundó la Compañía Harinera del Golfo, S.A. que por muchos años fue la principal proveedora de harina en la península de Yucatán.

[cita requerida] Después de los asesinatos de su sobrino y del vicepresidente José María Pino Suárez, Ernesto Madero huyó a Cuba y posteriormente residió en Nueva York y en San Antonio, Texas.

[cita requerida] Regresó al país y continuó administrando las empresas de la familia Madero, además fundó una agencia de publicidad.

Estuvo casado con Leonor Olivares Tapia, con quien procreó 9 hijos.