[4] Antes del año 1500, la zona estuvo poblada con presencia de los Paltas en cinco Señoríos, incluyendo Calvas, Garruchambas, Ambocas, Chaparra y Malacatos-Vilcabamba.En el mismo año, el nombre "El Cisne" es establecido por el obispo Luis López de Solís.La llegada al nuevo lugar estuvo marcada por una tormenta y viento que destruyó las viviendas, generando el pedido de los nativos a los colonos de abandonar el lugar.Raúl Vela Chiriboga, obispo de Azogues y el Mons.[10][11]En 1980, el papa Juan Pablo II lo elevó a categoría de Basílica Menor y en 2018 la Conferencia Episcopal Ecuatoriana lo declara Santuario Nacional.El 17 de agosto la procesión comienza desde El Cisne (lugar donde está su santuario).
Romería de la Virgen de El Cisne el 20 de agosto de 2016. Imagen en el altar de la
Catedral de Loja