No obstante, en septiembre del mismo año, tras haber recibido el refuerzo del Cuerpo de Ejército del teniente general James Longstreet, procedente del Ejército de Virginia septentrional, el ejército del Tennessee estaba en disposición de infligir una dura derrota a las tropas de Rosecrans, como efectivamente se produjo en Chickamauga, lo que permitió a Braga establecer el sitio de Chattanooga.
Bragg fue relevado de su mando como consecuencia de esta grave derrota, confiándose el mando al general Joseph E. Johnston, que era más apreciado por la tropa y por los oficiales que su predecesor.
La forma en que Hood ejerció el mando del Ejército resultó ser desastrosa para la Confederación.
Durante ese tiempo Hood intentaba esquivar en Tennessee al Ejército del Cumberland, al mando del mayor general George Thomas, y al Ejército del Ohio a cuyo frente se encontraba el mayor general John Schofield.
Se indica seguidamente una relación de las principales batallas y campañas en las que participó el Ejército del Tennessee, indicando igualmente quién era en ese momento el comandante en jefe del Ejército: