Ecosistema de agua dulce

Estos incluyen lagos, estanques, ríos, arroyos, manantiales, pantanos y humedales.

[6]​ Las presiones químicas comunes que afectan la salud de los ecosistemas de agua dulce incluyen la acidificación, la eutrofización y la contaminación por cobre y pesticidas.

Las algas también son taxonómicamente diversas, fáciles de recolectar, sensibles a una variedad de factores estresantes y, en general, valiosas para el ecosistema.

[12]​ Las algas crecen muy rápidamente y las comunidades pueden representar cambios rápidos en las condiciones ambientales.

[4]​ Los resultados experimentales de una sola especie en condiciones controladas pueden no reflejar las condiciones naturales y las comunidades de múltiples especies.

Estas condiciones de referencia temporal suelen ser más fáciles de reconstruir en agua estancada que en agua en movimiento porque los sedimentos estables pueden preservar mejor los materiales usados como indicadores biológicos.