Proviene del Quechua Uchuc = Pequeño y Marca = Pueblo.
La hacienda Uchumarca, de los Proano-Arias, la cual contaba con ganado vacuno y ovino y amplia agricultura, fue tomada violentamente en 1961 por campesinos del área en lo que se conoce como la Reforma Agraria.
Los españoles cuando fundaban pueblos acostumbraban bautizarlos dándole primeramente el nombre del santo patrón y luego el nombre de la comunidad, parcialidad o comarca.
Por esta razón, el pueblo fue designado como San Juan Bautista de Uchucmarca.
El Instituto Geográfico Nacional ha omitido el nombre de su Santo Patrón y solamente admite el del distrito y comunidad, al que pertenece Uchucmarca.