En 2002 fue campeón de la Copa Ford Puma y 2003 hizo lo mismo en el Trofeo Renault Clio V6.
Al año siguiente compitió esporádicamente en la categoría, aunque logró su primera victoria en ella.
Ganó una carrera y subió al podio en 10 de 13, lo cual le significó obtener el título.
Con idéntica montura y acompañado habitualmente de Miller o Dominik Farnbacher, Werner quedó 11º en la serie Grand-Am 2008 con tres podios.
Por otra parte, llegó tercero absoluto en las 24 Horas de Spa, nuevamente en un BMW M3 oficial.
En 2013, obtuvo un segundo lugar y tres octavos como únicos resultados puntuables, quedando así 13º en la tabla de puntos.