La diócesis tiene 16 000 km² y extiende su jurisdicción sobre los fieles católicos de rito latino residentes en 9 municipios del departamento de Nariño: Barbacoas, El Charco, Francisco Pizarro, La Tola, Magui, Mosquera, Olaya Herrera, Roberto Payán y Tumaco.

[3]​ La nueva circunscripción eclesiástica fue encomendada a la comunidad de los padres agustinos y comprendía en ese entonces: Tumaco, Barbacoas, Santa Bárbara de Iscuandé, Ricaurte, Guapi y Puerto Merizalde.

El primer prefecto fue Bernardo Merizalde Morales quien impulsa la educación, la construcción del ferrocarril Tumaco-Pasto y otras obras de promoción social.

[5]​ El 7 de febrero de 1961 la prefectura apostólica fue elevada a vicariato apostólico mediante la bula Regnum Christi del papa Juan XXIII.

[7]​ El 29 de octubre de 1999 el vicariato apostólico fue elevado a diócesis con la bula Carmelitarum Excalceatorum del papa Juan Pablo II.