Inicialmente la prefectura apostólica estuvo encomendada a los misioneros de la Compañía de Jesús; en 1879 se hicieron cargo los espiritanos.
El 2 de febrero de 1932, en virtud del breve Supremi apostolatus del papa Pío XI, la prefectura apostólica se amplió adquiriendo parte del territorio continental que pertenecía a la prefectura apostólica de Diego Suárez (hoy arquidiócesis de Antsiranana).
[2] El 8 de marzo de 1951 la prefectura apostólica fue elevada a vicariato apostólico con la bula Ad potioris dignitatis del papa Pío XII.
[3] El 14 de septiembre de 1955 el vicariato apostólico fue elevado a diócesis con la bula Dum tantis del papa Pío XII.
Al mismo tiempo, la nueva diócesis se convirtió en sufragánea de la arquidiócesis de Tananarive.