Su punto más bajo está a 34 metros bajo el nivel del mar,[1][2] lo que la convierte no sólo en la mayor depresión del Perú, sino también de América Latina y del Hemisferio Sur, luego de las depresiones de Gran Bajo del Gualicho y Gran Bajo de San Julián, en Argentina.
Este punto se localiza a 60 km al sur de la ciudad de Sechura y aproximadamente 40 km del puerto de Bayóvar.
La Depresión de Bayóvar es ocasionalmente llenada con las aguas desbordadas de los ríos Motupe y La Leche, por ejemplo durante el fenómeno conocido como «El Niño» en los años 1925, 1983, 1997 y 1998, formando la laguna de La Niña.
En la actualidad está seca y constituye una salina.
La depresión rica en depósitos de fosfatos y otros minerales, es explotada desde los tiempos prehispánicos y en la actualidad se ha cedido en concesión a una empresa extranjera para su administración y explotación.