Se sitúa a ochenta y ocho kilómetros al norte de Bogotá.

El topónimo Cucunubá, en muysc cubun (idioma muisca) quiere decir «semejanza de cara», según Acosta Ortegón.

[3]​ Una amplia zona del municipio se encuentra ubicada en el valle de Ubaté, a la vez que otro sector se encuentra en un área montañosa que alcanza los 3200 m s. n. m., correspondientes a la Cordillera Oriental.

Entre los puntos más altos se destacan los cerros de La Campana, La Esquina, Mata Redonda y Pajonal, entre otros.

Las veredas de mayor producción son Pueblo Viejo, Peñas, La Ramada, Aposentos y El Tablón.