[2]​ La parte occidental de la cordillera pertenece a la cuenca del río Magdalena, mientras que la vertiente oriental incluye las cuencas hidrográficas de los ríos Amazonas, el Orinoco y el Catatumbo.

Importantes ciudades como Bogotá, la capital de Colombia y Tunja se encuentran en ella.

Sin embargo, retomado el poder en España por Fernando VII, este envió una expedición de reconquista en 1815.

El virreinato reinstaurado castigó duramente a los criollos que participaron de los levantamientos (patriotas) consolidándose un régimen del terror al mando del virrey Juan de Sámano.

Varios grupos patriotas sobrevivieron, bien como guerrillas, bien formando grandes ejércitos en zonas como los Llanos.