Jesús Alzugaray (8 goles) La Copa del Rey de Fútbol 1988-89 fue la edición número 85 de dicha competición española.

Contó con la participación de 119 equipos.

Fue ganado por el Real Madrid C. F. por 1 - 0 al Real Valladolid Deportivo, siendo el 16.º título de Copa obtenido por el equipo madrileño.

Para el equipo vallisoletano este subcampeonato, junto con el obtenido en la 1949/50, es lo más lejos que ha alcanzado en esta competición.

Como el Real Madrid C. F. también fue campeón de liga, el Real Valladolid Deportivo representó al fútbol español en la Recopa.