Como en ediciones anteriores, cuatro equipos obtuvieron un bye o una clasificación directa para la ronda principal, estos fueron los participantes de la Liga de Campeones Élite 2024-25 y Urawa Red Diamonds (Participante en la Copa Mundial de Clubes de la FIFA 2025) esto debido a un conflicto de calendario ya que las tres competiciones se jugaron en fechas similares.
[2] En esta ronda ingresaron 57 equipos que fueron divididos en 10 grupos por cercanía geográfica.
Como norma general, el club de la liga inferior jugó su partido en casa.
En caso de empate, los partidos fueron a prórroga y penales para determinar un ganador si era necesario.
Los cinco clubes restantes avanzaron a la fase principal.