La condensina II está presente dentro del núcleo celular durante la interfase y está involucrada en las etapas más tempranas de la condensación de cromosomas durante la profase del núcleo.
Por otro lado, la condensina I está presente en el citoplasma durante la interfase, y gana acceso a los cromosomas solo luego de que la envoltura nuclear se rompe, al final de la profase.
Los dos complejos aparentemente permanecen asociados con los cromosomas luego que las cromátidas hermanas se separan, en la anafase.
Algunas especies de procariotas también poseen complejos proteicos similares a las condensinas que juegan un papel importante en la organización y la segregación cromosómica.
Los condensinas procariotas se pueden clasificar en dos tipos: SMC-ScpAB[5] y MukBEF.
Por otra parte, la condensina I está presente en el citoplasma durante la interfase, y sólo puede acceder a los cromosomas después de romper la envoltura nuclear al final de la profase.