Él y su alumno Nao Tsuchiya inventaron el paradigma llamado Continuous flash suppression (CFS) algo como una "supresión continua por resplandor",[6]​ una eficiente técnica de psicofísica de enmascaramiento sensorial, para representar imágenes invisibles durante muchos segundos.

Ésta describe la relación entre el núcleo basal llamado el claustro, estructura anatómica misteriosa situada debajo de la corteza insular y su relación con la conciencia humana.

[8]​ Durante la última década, Koch ha trabajado en estrecha colaboración con el psiquiatra y neurocientífico Giulio Tononi.

Koch aboga por una variante moderna del panpsiquismo, la antigua creencia filosófica de ver o encontrar la conciencia en todas las cosas que nos rodean.

[10]​[11]​ Koch escribe una columna popular llamada "Consciousness Redux", para Scientific American Mind sobre temas de divulgación científica, relacionadas con la conciencia y neurociencia.

A principios del 2011[14]​ Christof Koch se convirtió en el director científico del Instituto Allen (AI), liderando su proyecto por diez años en relación con el proceso de alto rendimiento a gran escala de codificación cortical "high-throughput large-scale cortical coding".