[2] Su padre fue Juan Christian, quien después llegaría a ser el Conde Palatino de Sulzbach.Los esposos vivieron separados y Carlos Teodoro tuvo varios hijos ilegítimos con diversas amantes.Una vez viudo y sin descendencia legítima, contrajo segundas nupcias en 1795 con la archiduquesa María Leopoldina de Austria-Este (1776-1848), 52 años más joven que él.La joven esposa rehusó todo contacto físico con él, le humilló en público y tuvo amantes.Contrató a Johann Stamitz como "director musical instrumental" para que reformara y ampliara la orquesta de la corte, en la que figuraban destacados instrumentalistas europeos, así como excelentes cantantes.Parecía que la idea de fundar en Mannheim un teatro nacional estaba en peligro, pero el Príncipe aprobó los fondos necesarios para contratar una compañía fija para el teatro (Nationaltheater) recién construido y nombró director artístico a Wolfgang Heribert von Dalberg, que vino de Gotha.Al morir Maximiliano José sin descendencia en 1777, Carlos Teodoro fue su sucesor y, según lo acordado, trasladó su residencia de Mannheim a Múnich.Luego intentó canjear los Países Bajos Austriacos por Baviera, lo cual no le granjeó muchas simpatías entre la población.En 1784 prohibió todas las asociaciones que se habían fundado sin la autorización del soberano.En 1989, Marvin E. Thomas argumentó en Karl Theodor and the Bavarian Succession, 1777-1778 que Carlos Teodoro había querido mantener la posesión de su nuevo territorio, como se desprende de su correspondencia diplomática.
Armas de Carlos Teodoro como elector de Baviera y caballero de la Orden del Toisón de Oro
Los hijos legitimados de Carlos Teodoro con la segunda de sus amantes.