El matrimonio se celebra el año 1565 y trae como consecuencia un hijo Jacobo quien más tarde se convertiría en heredero de los tronos de Inglaterra y Escocia.Sin embargo las acusaciones recaen sobre su viuda María, quien fue obligada a abdicar en favor de su hijo y puesta en prisión.En 1574 Margarita Douglas urde una nueva alianza dinástica, esta vez con su hijo menor como protagonista.Ambas abuelas pidieron que Arabella heredara el condado de Lennox pero la solicitud fue rechazada ya que Carlos no había tenido herederos varones.Carlos fue enterrado en la Capilla de Enrique VII en la Abadía de Westminster, al morir su madre dos años después fue enterrada en la misma tumba que él.
Carlos Estuardo junto a sus padres y su sobrino
Jacobo VI
en el funeral de su hermano Enrique.
