Se jugó en dos fases sucesivas, los torneos Apertura 1999 y Clausura 2000, las cuales coronaron cada una a su propio campeón.
El ganador de cada serie disputó la siguiente temporada en la Primera División, mientras que el perdedor lo hizo en la segunda categoría.
Lo mismo sucedió con Instituto, que perdió la categoría tras caer en su respectiva promoción ante Almagro.
Por su parte, Belgrano igualó en su serie ante Quilmes, y logró permanecer en Primera División.
Es hasta ahora la última participación de Ferro Carril Oeste en la máxima categoría del fútbol argentino.