Al igual que su padre antes, Bohemundo tenía una conocida aversión por los Caballeros Hospitalarios y el vecino Reino de Armenia, prefiriendo una alianza con los Caballeros Templarios.

Su segundo matrimonio fue en 1235 con Lucía de Segni, la sobrina nieta del papa Inocencio III.

Puesto que su hijo y sucesor sólo tenía 15 años en ese entonces, ascendió bajo la regencia de la princesa viuda, Lucía.

Sin embargo, Lucía nunca dejó Trípoli, y en su lugar entregó el gobierno del principado a sus familiares romanos.

Esto la hizo impopular, por lo que el joven Bohemundo VI obtuvo la aprobación del rey Luis IX de Francia, que estaba en la Cruzada en ese momento, para obtener el permiso del papa Inocencio IV para obtener su mayoría de edad unos meses antes.