La historia de esta bodega alcanza casi trescientos años en los cuales ha pertenecido a diferentes propietarios o grupos empresariales.

Debido a su delicado estado de salud, en el año 1745 solicita a su vecino y amigo Jean Haurie Nebout (1719-1794) su colaboración para poder ayudarle en la gestión de sus viñedos y bodegas.

Constituyó su propia bodega en Jerez en 1816 y varios años después en 1821 firmó la adquisición de "Juan Haurie y Sobrinos" a Juan Carlos Haurie Puzein quien se encontraba en quiebra.

En el año 1857 la compañía Pedro Domecq figuraba como la bodega con mayores existencias de Vino de Jerez en el marco, seguida en segundo lugar por Patricio Garvey y en tercer lugar por Pemartín y Cía.

En este periodo, Juan Pedro sigue incrementando el negocio de la bodega, incluso ampliando sus actividades ganaderas e incorporando el Palacio del Marqués de Montana, conocido como Palacio Domecq, entre sus principales activos.

Puesto que aquel cliente no pudo hacer frente al pago del producto acordado, las botas quedaron almacenadas en la Bodega de La Luz, donde años más tardes fueron catadas, descubriendo un producto similar al Coñac francés con una gran personalidad.

Partiendo de este descubrimiento Pedro Domecq Loustau decidió comercializar embotellado dicho extraordinario producto como el primer brandy español.

Dado el éxito del nuevo brandy Fundador y la elevada demanda de alcoholes, aguardientes y holandas que demandaba el negocio, la compañía decide construir en 1880 una destilería propia en Tomelloso (Ciudad Real).

Probablemente, dichas circunstancias más el extenso y distribuido paquete accionarial, aún en manos de la familia Domecq, en el año 1941 la empresa se convierte en una Sociedad Anónima, denominándose Pedro Domecq, S.A.

Tras esta primera época, Jaime Sánchez Briñas estuvo liderando la compañía desde 1950 hasta 1970, siendo el primer director general que no pertenecía a la familia.

Durante su gestión se acometieron importantes reformas organizativas para profesionalizar la empresa y el negocio.

Fue una época de mucha actividad promocional, donde la marca del brandy Fundador se posicionó como un referente a nivel nacional e internacional.

Este proceso de restructuración duraría hasta el año 1984, cuando se vuelven a obtener beneficios.

En el año 1994, la multinacional británica Allied Lyons adquiere todas las empresas, activos y marcas del grupo Pedro Domecq creando una nueva sociedad denominada Allied Domecq, constituyéndose en aquel momento en la segunda mayor empresa en el mundo de bebidas alcohólicas.

En esta operación se crea una nueva gran compañía denominada Beam Global para gestionar todos los activos y marcas adquiridos por Fortune Brands.

Sin embargo, marcas tradicionales hasta el momento de la compañía como los brandies Carlos I y Carlos III, así como los vinos Fino La Ina, Oloroso Río Viejo y Amontillado Botaina, quedan en manos de Pernod Ricard quien a su vez acuerda su venta al Grupo Osborne en el año 2008, pasando más tarde las marcas de vino al Grupo Caballero.

Más tarde, en el año 2014, la multinacional japonesa Suntory adquiere los activos y marcas de Beam Global, constituyendo una nueva sociedad denominada Beam Suntory a la que pasó a pertenecer esta organización.

En dicha operación se hace necesario realizar la segregación de los activos y marcas de Beam Suntory e incorporarlas a una nueva sociedad propiedad del grupo Emperador que pasa a denominarse Bodegas Fundador, recuperando la identidad de esta compañía y su vínculo con el sector.

Durante su larga trayectoria ha sido reconocida con diferentes premios y galardones internacionales, siendo los últimos más destacados como la mejor bodega del mundo en la International Wine Competition en 2005, la mejor bodega de Andalucía en los premios Andalucía Excelente en 2016, la mejor bodega de vinos fortificados del mundo en la International Wine and Spirits Competition en 2017 y 2019, finalista como mejor bodega de brandy del mundo en la International Wine and Spirits Competition en 2017, 2018 y 2020, mejor vino del mundo para Harveys VORS 30YO Amontillado en la International Wine Challenge en 2016 y mejor brandy del mundo para Fundador Supremo 18 en la International Wine and Spirits Competition en 2019.