Cuenta con más de 80 carreras, entre las que destacan:[4]​ Física, Matemáticas, Derecho, Ciencias Políticas, Medicina, Administración e Ingeniería.

[6]​ Este templo se desapegó del estilo de las construcciones monacales del siglo XVI hacia un estilo más español, basado en formas más rectangulares y distribuidos, en este caso, en cuatro patios diferentes.

Debido a la alta afluencia al templo, en el siglo XVIII se planteó derribarlo y construir uno nuevo más grande, que inició H. Juan Gómez y terminó el maestro de obra José Miguel de Santamaría hacia 1767.

En 1825 el Congreso local otorga al gobierno la Suprema Inspección sobre el Colegio del Espíritu Santo.

No obstante se logró la completa separación de las autoridades eclesiásticas en el gobierno del colegio, los rectores continuaron por algunos años siendo sacerdotes.

Numerosos hombres del liberalismo se trasladaron a organizar la educación en Puebla; entre ellos, Ignacio Ramírez "el Nigromante" y Guillermo Prieto.

La institución quedó a disposición de los dictados del gobierno, lo que motivaría los movimientos universitarios posteriores.

Durante este movimiento se presentaron varios proyectos elaborados por agrupaciones de alumnos, que fueron aprovechados e impulsados por la Federación Estudiantil Poblana.

Alrededor del año 1956, la universidad contaba con un total de 2500 alumnos inscritos, todos tomando cursos en el Edificio Carolino.

Existía una marcada diferencia social, política y económica entre los sectores que conformaban la comunidad estudiantil de la casa de estudios, por ejemplo, se asistía a misa los primeros días de cada mes y al final del ciclo escolar, además, existían alumnos y docentes que llegaban en automóviles lujosos a laborar.

Así, después de lograda la autonomía, la universidad se caracterizó por una fuerte tendencia conservadora, católica y anticomunista.

Se crearon distintas asociaciones de acuerdo a las tendencias políticas y sociales existentes en la comunidad universitaria como el Frente Universitario Anticomunista (FUA), una cara pública del Organización Nacional del Yunque establecido en 1955 por el grupo conservador o la Federación Estudiantil Poblana (FEP) fundada en 1956 con Francisco Arellano Campo como primer líder.

La visita de Prado ocasionó fuertes manifestaciones por parte del alumnado conservador, puesto que rechazaba totalmente la Revolución Cubana.

El doctor Manuel Lara y Parra fue el primer rector elegido con esta nueva modalidad para el periodo 1963-1966.

Se incorporaron plenamente al movimiento nacional desde agosto de 1968, fecha en la que las escuelas de Economía, Filosofía y Letras, Medicina, Leyes, Físico-Matemáticas y Preparatoria Nocturna estallan en huelga en apoyo a las demandas nacionales.

En 2011 se incorpora la modalidad a distancia, ofreciendo cuatro carreras: Administración de Empresas, Contaduría pública, Derecho y Comunicación.

[15]​ En 1956 se le agregó la leyenda de "autónoma", y en 1987 tras su declaración como "benemérita", dicho título fue colocado en la parte superior del emblema.

[16]​ Su lema, Pensar Bien, Para Vivir Mejor, fue creado en 1936 por el contador José Bustos, entonces secretario de la institución.

[15]​ La BUAP se divide por áreas, según su ubicación geográfica, ya sea en la Ciudad de Puebla o en el interior del estado.

La BUAP ofrece múltiples carreras a nivel licenciatura; también ofrece sus bachilleratos (preparatorias) y diversas disciplinas en educación a través de Internet (en línea), además de diversos posgrados (maestrías y doctorados).

Entre las obras se encontraron nuevas vialidades, edificios públicos y privados, la zona del nuevo Centro Cultural 5 de mayo (conocido como Los Fuertes) y diversos emplazamientos importantes del Centro Histórico como el Parián o el mismo Zócalo.

Las diversas carreras estaban distribuidas en pisos, sótanos y catacumbas del centenario edificio, incluso azoteas.

[18]​ El Plan Maestro de la ciudad fue liderado por los arquitectos Miguel Pavón Rivero y Jorge Bélchez.