Cuando llegó a la mayoría de edad, Baltasar eligió una carrera eclesiástica.

Probablemente no estaba satisfecho con la vida eclesiástica y regresó al estado laico en 1479.

Su hermano Alberto VI recibió la parte mayor del anterior principado de Werle, mientras Baltasar y su hermano Magnus II administraron juntos el resto del ducado.

Después de que muriera Magnus, Baltasar gobernó junto con los hijos de Magnus.

Se casó con Margarita, hija del duque Erico II de Pomerania, en 1487.