Su madre, Catalina, y su tío, Alberto V, actuaron como regentes hasta 1436.
Después el duque Ulrico II de Mecklemburgo-Stargard murió en 1471, Mecklemburgo fue de nuevo unida bajo un solo gobernante.
Después de la muerte de Enrique gobernaron conjuntamente, hasta que Juan murió en 1474 y Alberto en 1483.
Su hermano menor, Baltasar se preocupó poco de los asuntos del gobierno.
Enrique murió en 1477 y fue enterrado en la abadía de Doberan.