Sin embargo, los acontecimientos (posiblemente la guerra de los Seis Días en 1967) lo encaminaron por un rumbo mucho más radical.A sus 14 años, ya formaba parte de los Hermanos Musulmanes, grupo islamista radical.Para 1979 ya se había integrado en la yihad islámica, donde acabó por convertirse en uno de los principales organizadores y reclutadores.Aymán az Zawahirí hablaba tres idiomas: árabe, inglés y francés.Ahí conoció a Osama bin Laden, quien dirigía una base de muyajidines llamada Majtab al-Jidamat; ambos trabajaron bajo la tutela del palestino Abdullah Azzam.El objetivo falló pero una niña de 12 años murió, lo que le costó el repudio popular.Ese mismo año perpetró un ataque contra la embajada egipcia en Islamabad, Pakistán, que costó la vida a 16 personas.
El presidente Biden pronuncia comentarios confirmando que el ejército estadounidense mató a al-Zawahiri.