Kupiainen completó su educación universitaria en 1976 en la Universidad Técnica de Helsinki y recibió su doctorado.
[2] Fue profesor invitado en varias instituciones, entre ellas IHES, la Universidad de California, Santa Bárbara, MSRI, École normale supérieure y el Institut Henri Poincaré.
Fue dos veces orador invitado en el Congreso Internacional de Matemáticos; Sus charlas ICM fueron en 1990 en Kyoto sobre Renormalization group and random systems and in 2010 at Hyderabad on Origins of Diffusion.
Recibió una Beca Avanzada del Consejo Europeo de Investigación (ERC) para el período 2009-2014.
[14] [15] En 1996, Kupiainen y Bricmont aplicaron métodos de alta temperatura desde la mecánica estadística a sistemas dinámicos caóticos.