[1]​ La mayor parte de su producción se encuentra en Madrid (ciudad de la que fue nombrado Maestro Mayor, cargo equivalente al de arquitecto municipal, en 1814), donde realizó numerosas obras para mayor gloria del rey Fernando VII.

Así, se le deben la puerta de Toledo y el proyecto del Teatro Real.

De este último, si bien la duración del periodo constructivo (su construcción la comenzó López Aguado en 1818 y se prolongó hasta 1850, con importantes reformas en el siglo XX) desfiguró en gran medida el proyecto original, son responsabilidad de López Aguado la planta en forma de hexágono irregular alargado, su disposición frente al Palacio Real al otro lado de la plaza de Oriente, y su escena rectangular de gran tamaño.

Trabajó también en la consolidación y acondicionamiento del edificio de Villanueva para el Museo Fernandino (1814-1831), en lo que sería posteriormente el Museo del Prado.

Otras obras suyas son el palacio del duque de Villahermosa (edificio que actualmente alberga el Museo Thyssen-Bornemisza de Madrid), y el Palacio de Fernán Núñez.