Unos años más tarde fue nombrado comandante del mismo, reemplazando al coronel Agustín de Pinedo.

Intercedió por la vida de varias personas y logró salvar a algunos, como al coronel Pedro José Díaz.

La ejecución más conocida que debió llevar a cabo fue la del cura Uladislao Gutiérrez y de su amante, Camila O’Gorman.

Había tratado con suma amabilidad a la prisionera, y se ocupó de consolarla en todo lo que pudo.

Fue ministro del gobierno provisional que dirigía el general Lagos, reemplazando en el cargo a Marcos Paz en enero de 1853.

Cuando el sitio fue levantado, se presentó voluntariamente en Luján al general José María Flores, que le garantizó su seguridad personal.

Cabe aclarar que Torres y muchos otros dirigentes también habían sido partidarios de Rosas.

Tras un nuevo juicio en ausencia, durante el cual fue defendido por el abogado y periodista chileno Manuel Bilbao, fue sobreseído oficialmente en junio de 1855.