La tercera temporada de Eesti otsib superstaari se estrenó el 6 de septiembre de 2009. El ganador de la temporada fue Ott Lepland .
En otoño de 2008, TV3 anunció que la tercera temporada se aplazaría y que el programa fue reemplazado por el nuevo programa Eesti otsib lemmiklaulu (Estonia busca una canción favorita) . En junio de 2009, TV3 anunció que las audiciones para la tercera temporada comenzarían en agosto de 2009.
En julio de 2009, la Radiodifusión Pública de Estonia (ERR) anunció que una de las jurados, Heidy Purga, no podía participar en ese programa. Purga es directora de la emisora de radio de la ERR, Raadio 2. La ERR explicó que la decisión se tomó porque en este momento hay mucho trabajo por hacer en Raadio 2 y no le permitirán participar en el programa de la competencia.
Varios días después, TV3 anunció nuevos presentadores y un nuevo juez. Los presentadores de la tercera temporada son la estrella de rock ganadora del Festival de la Canción de Eurovisión Tanel Padar y la cantante Ithaka Maria . Heidy Purga fue reemplazada por la cantante Maarja-Liis Ilus .
Esta temporada también tuvo representantes de Estonia en el Festival de la Canción de Eurovisión tres veces seguidas: Robin Juhkental , que llegó a las semifinales del programa, representó a su país como cantante principal de Malcolm Lincoln en 2010; Getter Jaani , que terminó en cuarto lugar, cantó para Estonia en 2011 y Ott Lepland , el ganador de la temporada, tuvo su turno en 2012 logrando el sexto lugar en el concurso. Cinco años después, la semifinalista Elina Nechayeva obtuvo un octavo lugar en la Gran Final del concurso.
Las audiciones para 2009 se llevaron a cabo en Pärnu (19 de agosto), Rakvere (26 de agosto), Tartu (29 y 30 de agosto) y Tallin (22 y 23 de agosto). Sólo entre 60 y 80 cantantes calificaron para la ronda de teatro.
Las rondas de teatro se celebraron el 7 y 8 de septiembre de 2009 en el Vene Teater (Teatro Ruso en Estonia). 25 nuevos cantantes se clasificaron para las semifinales.
Veinticinco nuevos cantantes se clasificaron para las rondas de estudio: 13 mujeres y 12 hombres. Las rondas de estudio se llevan a cabo en dos semanas. La primera semana es la semana de las chicas y la segunda es la semana de los chicos. Durante la semana se realizan dos espectáculos. En el primer espectáculo participan todas las chicas o todos los chicos. Los jueces tienen derecho a enviar a un participante directamente a la final. Entre otros, ocho nuevos cantantes son enviados al segundo espectáculo. En el segundo espectáculo, cuatro cantantes son enviados a la final por los televotadores.
Eliminadas: Kristiina Freimane, Maria Alanurme, Liisa Orav, Anna Kutšinskaja
Avanzada a la final (elección de los jueces): Kene Vernik
Eliminadas: Kerli Kivilaan, Elina Nechayeva , Sabrina Abdullajeva, Liina Uibo
Avanzada a la final: Getter Jaani, Eliisa Kõiv, Anne Arrak, Birgit Varjun
Eliminados: Sten-Martin Saarest, Robin Juhkental , Kristen Kasuk
Avanzado a la final (elección de los jueces): Anis Arumets
Eliminados: Karel Tallermaa, Beno Kudrin, Keito Kaljulaid, Mick Pedaja
Avanzaron a la final: Marten Kuningas, Ott Lepland, Andrei Ozdoba, Jaanus Saago
(Edades indicadas al momento del concurso)
Tres últimos: Getter Jaani, Jaanus Saago, Anne Arrak
Dos últimos: Getter Jaani, Anne Arrak
Eliminados: Anne Arrak Nadie [1]
Tres últimos: Andrei Ozdoba, Anis Arumets, Eliisa Kõiv
Eliminados: Andrei Ozdoba, Eliisa Kõiv
Los tres últimos: Anis Arumets, Jaanus Saago, Kene Vernik
Eliminado: Kene Vernik
Tres últimos: Jaanus Saago, Anne Arrak, Marten Kuningas
Dos últimos: Marten Kuningas, Anne Arrak
Eliminada: Anne Arrak
Dos últimos: Getter Jaani, Anis Arumets
Eliminado: Anis Arumets
Dos últimos: Birgit Varjun, Jaanus Saago
Eliminados: Jaanus Saago
Dos últimos: Getter Jaani, Birgit Varjun
Eliminadas: Getter Jaani
Eliminado: Marten Kuningas
La superfinal de Eesti otsib superstaari se celebró el 20 de diciembre de 2009 en el Linnahall Arena de Tallin . Los dos superfinalistas interpretaron tres canciones: una conocida canción navideña, su interpretación favorita de la temporada y la canción del ganador. El ganador fue elegido por los espectadores mediante votación telefónica y por SMS.
Ganador: Ott Lepland
Subcampeón: Birgit Varjun