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Fragmentación (espectrometría de masas)

En espectrometría de masas, la fragmentación es la disociación de iones moleculares energéticamente inestables que se forman al pasar por el espectro de masas de las moléculas . Estas reacciones están bien documentadas a lo largo de décadas y los patrones de fragmentación son útiles para determinar el peso molar y la información estructural de moléculas desconocidas. [1] [2] La fragmentación que se produce en experimentos de espectrometría de masas en tándem ha sido un foco de investigación reciente, porque estos datos ayudan a facilitar la identificación de moléculas. [3]

Fragmentación de tolueno

Técnicas de espectrometría de masas.

La fragmentación puede ocurrir en la fuente de iones (fragmentación en la fuente) [4] [5] donde se ha utilizado con ionización electrónica [4] para ayudar a identificar moléculas y, recientemente (2020), con ionización por electropulverización se ha demostrado que proporciona el mismo beneficio al facilitar la identificación molecular. [5] Antes de estos experimentos, [5] [6] la fragmentación en la fuente por ionización por electropulverización generalmente se consideraba un efecto no deseado [7] sin embargo, se ha demostrado que la ionización por electropulverización utilizando fragmentación/anotación mejorada en la fuente (EISA) promueve en -fragmentación de fuente que crea iones fragmentados que son consistentes con los espectrómetros de masas en tándem. [5] [6] La fragmentación generada por espectrometría de masas en tándem generalmente se realiza en la zona de colisión (fragmentación posterior a la fuente) de un espectrómetro de masas en tándem . EISA y la disociación inducida por colisión (CID), entre otros eventos físicos que impactan a los iones, son parte de la química de los iones en fase gaseosa . Algunos tipos diferentes de fragmentación de masa son la disociación inducida por colisión (CID) mediante la colisión con una molécula neutra, la disociación inducida por superficie (SID) que utiliza la colisión de iones de movimiento rápido con una superficie sólida, la disociación inducida por láser que utiliza un láser para inducir la formación de iones, disociación por captura de electrones (ECD) debido a la captura de electrones de baja energía, disociación por transferencia de electrones (ETD) mediante transferencia de electrones entre iones, disociación por transferencia de electrones negativa (NETD), disociación por desprendimiento de electrones (EDD), fotodisociación , particularmente multifotón infrarrojo disociación (IRMPD) que utiliza radiación IR para el bombardeo y disociación radiativa infrarroja de cuerpo negro (BIRD), que utiliza radiación IR en lugar de láser, disociación con trampa C (HCD) de mayor energía, EISA y fragmentación remota de carga . [8] [9] [10]

Reacciones de fragmentación

La fragmentación es un tipo de disociación química, en la que la eliminación del electrón de la molécula da como resultado la ionización. La eliminación de electrones del enlace sigma, del enlace pi o de los orbitales no enlazantes provoca la ionización. [2] Esto puede tener lugar mediante un proceso de escisión homolítica o homólisis o escisión heterolítica o heterólisis del enlace. La energía relativa del enlace y la capacidad de sufrir estados de transición cíclicos favorables afectan el proceso de fragmentación. Las reglas para los procesos básicos de fragmentación vienen dadas por la regla de Stevenson.

Homólisis
heterólisis

Dos categorías principales de patrones de escisión de enlaces son las reacciones de escisión de enlaces simples y las reacciones de reordenamiento. [2]

Reacciones de ruptura de enlaces simples

La mayoría de los compuestos orgánicos experimentan reacciones de escisión de enlaces simples, en las que tiene lugar la escisión directa del enlace. La escisión del enlace sigma, la fragmentación iniciada por el sitio radical y la fragmentación iniciada por el sitio de carga son algunos tipos de reacciones de escisión de enlaces simples. [2]

Un ejemplo de escisión del enlace sigma

Escisión del enlace sigma / escisión σ

La escisión del enlace sigma se observa con mayor frecuencia en moléculas, que pueden producir cationes estables como alcanos saturados y carbocationes secundarios y terciarios . Esto ocurre cuando se elimina un electrón alfa. El enlace CC se alarga y se debilita provocando fragmentación. La fragmentación en este sitio produce un fragmento cargado y otro radical. [2]

Un ejemplo de fragmentación radical iniciada por un sitio.

Fragmentación radical iniciada por el sitio

La escisión del enlace sigma también ocurre en cationes radicales alejados del sitio de ionización. Esto se observa comúnmente en alcoholes , éteres , cetonas , ésteres , aminas , alquenos y compuestos aromáticos con un carbono unido al anillo. El catión tiene un radical en un heteroátomo o un grupo funcional insaturado. La fuerza impulsora de la fragmentación es la fuerte tendencia del ion radical al apareamiento de electrones. La escisión ocurre cuando el radical y un electrón impar de los enlaces adyacentes al radical migran para formar un enlace entre el carbono alfa y el heteroátomo o el grupo funcional insaturado. El enlace sigma se rompe; de ahí que esta escisión también se conozca como escisión de enlace homolítico o escisión α. [2]

Un ejemplo de fragmentación iniciada por el sitio de carga

Escisión iniciada en el sitio de carga

La fuerza impulsora de la fragmentación iniciada por el sitio de carga es el efecto inductivo del sitio de carga en los cationes radicales. Los electrones del enlace adyacente al átomo que lleva la carga migran hacia ese átomo, neutralizando la carga original y provocando que se mueva a un sitio diferente. Este término también se denomina escisión inductiva y es un ejemplo de escisión de enlaces heterolíticos. [2]

Un ejemplo de reordenamiento de McLafferty

Reacciones de reordenamiento

Las reacciones de reordenamiento son reacciones de fragmentación que forman nuevos enlaces produciendo una estructura intermedia antes de la escisión. Una de las reacciones de reordenamiento más estudiadas es el reordenamiento de McLafferty /reordenamiento de hidrógeno γ. Esto ocurre en los cationes radicales con grupos funcionales insaturados, como cetonas , aldehídos , ácidos carboxílicos , ésteres , amidas , olefinas , fenilalcanos. Durante esta reacción, el hidrógeno γ se transferirá al grupo funcional al principio y luego tendrá lugar la escisión del enlace α, β del intermedio. [2] Otras reacciones de reordenamiento incluyen la fisión del anillo heterocíclico (HRF), la fisión formadora de benzofurano (BFF), la fisión de metiluro de quinona (QM) o la fisión Retro Diels-Alder (RDA). [11]

Ver también

Referencias

  1. ^ McLafferty FW (1 de enero de 1993). Interpretación de espectros de masas. Libros de ciencias universitarias. ISBN 978-0-935702-25-5.
  2. ^ abcdefgh Dass C (2007). Fundamentos de la espectrometría de masas contemporánea ([Online-Ausg.]. Ed.). Hoboken, Nueva Jersey [ua]: Wiley. ISBN 978-0-471-68229-5.
  3. ^ Xue J, Guijas C, Benton HP, Warth B, Siuzdak G (octubre de 2020). "Base de datos de 2 estándares moleculares: un amplio recurso químico y biológico". Métodos de la naturaleza . 17 (10): 953–954. doi :10.1038/s41592-020-0942-5. PMC 8802982 . PMID  32839599. S2CID  221285246. 
  4. ^ ab Gohlke RS, McLafferty FW (1 de mayo de 1993). "Espectrometría de masas/cromatografía de gases temprana". Revista de la Sociedad Estadounidense de Espectrometría de Masas . 4 (5): 367–371. doi :10.1016/1044-0305(93)85001-E. PMID  24234933. S2CID  33972992.
  5. ^ abcd Xue J, Domingo-Almenara X, Guijas C, Palermo A, Rinschen MM, Isbell J, et al. (abril de 2020). "La anotación de fragmentación mejorada en la fuente permite la adquisición independiente de datos novedosos y la identificación molecular autónoma de METLIN". Química analítica . 92 (8): 6051–6059. doi :10.1021/acs.analchem.0c00409. PMC 8966047 . PMID  32242660. S2CID  214768212. 
  6. ^ ab Domingo-Almenara X, Montenegro-Burke JR, Guijas C, Majumder EL, Benton HP, Siuzdak G (marzo de 2019). "Anotación de fragmentos en fuente autónoma guiada por METLIN para metabolómica no dirigida". Química analítica . 91 (5): 3246–3253. doi : 10.1021/acs.analchem.8b03126. PMC 6637741 . PMID  30681830. 
  7. ^ Lu W, Su X, Klein MS, Lewis IA, Fiehn O, Rabinowitz JD (junio de 2017). "Medición de metabolitos: obstáculos que se deben evitar y prácticas a seguir". Revista Anual de Bioquímica . 86 (1): 277–304. doi :10.1146/annurev-biochem-061516-044952. PMC 5734093 . PMID  28654323. 
  8. ^ Yost RA, Enke CG (1978). "Fragmentación de iones seleccionados con un espectrómetro de masas de cuadrupolo en tándem". Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 100 (7): 2274–2275. doi :10.1021/ja00475a072.
  9. ^ Lermyte F, Valkenborg D, Loo JA, Sobott F (noviembre de 2018). "Soluciones radicales: principios y aplicación de la disociación basada en electrones en el análisis de la estructura de proteínas basado en espectrometría de masas" (PDF) . Reseñas de espectrometría de masas . 37 (6): 750–771. doi :10.1002/mas.21560. PMC 6131092 . PMID  29425406. 
  10. ^ Chen X, Wang Z, Wong YE, Wu R, Zhang F, Chan TD (noviembre de 2018). "Disociación basada en reacciones de iones de electrones: un poderoso método de activación de iones para la dilucidación de estructuras de productos naturales". Reseñas de espectrometría de masas . 37 (6): 793–810. doi :10.1002/mas.21563. PMID  29603345.
  11. ^ Li HJ, Deinzer ML (febrero de 2007). "Espectrometría de masas en tándem para secuenciar proantocianidinas". Química analítica . 79 (4): 1739–48. doi :10.1021/ac061823v. PMID  17297981.

enlaces externos