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SARS-CoV-2

El síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 ( SARS‑CoV‑2 ) [2] es una cepa de coronavirus que causa el COVID-19 , la enfermedad respiratoria responsable de la pandemia de COVID-19 . [3] El virus anteriormente tenía el nombre provisional de nuevo coronavirus 2019 ( 2019-nCoV ), [4] [5] [6] [7] y también ha sido llamado coronavirus humano 2019 ( HCoV-19 o hCoV-19 ). [8] [9] [10] [11] Identificado por primera vez en la ciudad de Wuhan , Hubei, China, la Organización Mundial de la Salud designó el brote como una emergencia de salud pública de importancia internacional desde el 30 de enero de 2020 hasta el 5 de mayo de 2023. [12] [13] [14] El SARS-CoV-2 es un virus de ARN monocatenario de sentido positivo [15] que es contagioso en humanos. [dieciséis]

El SARS-CoV-2 es una cepa de la especie de coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio agudo severo (SARSr-CoV), al igual que el SARS-CoV-1 , el virus que causó el brote de SARS de 2002-2004 . [2] [17] Existen cepas de coronavirus transmitidas por animales más estrechamente relacionadas con el SARS-CoV-2, siendo el pariente más conocido el coronavirus de murciélago BANAL-52. El SARS-CoV-2 es de origen zoonótico ; su estrecha similitud genética con los coronavirus de murciélago sugiere que surgió de un virus transmitido por murciélagos . [18] Se están realizando investigaciones para determinar si el SARS-CoV-2 provino directamente de los murciélagos o indirectamente a través de huéspedes intermediarios. [19] El virus muestra poca diversidad genética , lo que indica que el evento de contagio que introdujo el SARS-CoV-2 en los humanos probablemente haya ocurrido a finales de 2019. [20]

Los estudios epidemiológicos estiman que en el período comprendido entre diciembre de 2019 y septiembre de 2020 cada infección provocó un promedio de 2,4 a 3,4 nuevas infecciones cuando ningún miembro de la comunidad era inmune y no se tomaban medidas preventivas . [21] Sin embargo, algunas variantes posteriores se han vuelto más infecciosas. [22] El virus se transmite por el aire y se propaga principalmente entre personas a través del contacto cercano y a través de aerosoles y gotitas respiratorias que se exhalan al hablar, respirar o exhalar de otra manera, así como las que se producen al toser y estornudar. [23] [24] Entra en las células humanas uniéndose a la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2), una proteína de membrana que regula el sistema renina-angiotensina. [25] [26]

Terminología

Firma con nombre provisional "2019-nCoV"

Durante el brote inicial en Wuhan , China, se utilizaron varios nombres para el virus; algunos nombres utilizados por diferentes fuentes incluían "el coronavirus" o "coronavirus de Wuhan". [27] [28] En enero de 2020, la Organización Mundial de la Salud (OMS) recomendó "nuevo coronavirus 2019" (2019-nCoV) [5] [29] como nombre provisional para el virus. Esto estaba de acuerdo con la guía de la OMS de 2015 [30] contra el uso de ubicaciones geográficas, especies animales o grupos de personas en los nombres de enfermedades y virus. [31] [32]

El 11 de febrero de 2020, el Comité Internacional sobre Taxonomía de Virus adoptó el nombre oficial "síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2" (SARS-CoV-2). [33] Para evitar confusión con la enfermedad SARS , la OMS a veces se refiere al SARS-CoV-2 como "el virus COVID-19" en las comunicaciones de salud pública [34] [35] y el nombre HCoV-19 se incluyó en algunas investigaciones. artículos. [8] [9] [10] Refiriéndose al COVID-19 como el "virus de Wuhan" ha sido descrito como peligroso por funcionarios de la OMS y como xenófobo por muchos periodistas y académicos. [36] [37] [38]

Infección y transmisión

La transmisión de persona a persona del SARS‑CoV‑2 se confirmó el 20 de enero de 2020 durante la pandemia de COVID-19 . [16] [39] [40] [41] Inicialmente se asumió que la transmisión se producía principalmente a través de gotitas respiratorias provenientes de la tos y los estornudos dentro de un rango de aproximadamente 1,8 metros (6 pies). [42] [43] Los experimentos de dispersión de luz láser sugieren que hablar es un modo de transmisión adicional [44] [45] y de gran alcance [46] , en interiores, con poco flujo de aire. [47] [48] Otros estudios han sugerido que el virus también puede transmitirse por el aire , y que los aerosoles pueden transmitir el virus. [49] [50] [51] Durante la transmisión de persona a persona, se cree que entre 200 y 800 viriones infecciosos del SARS-CoV-2 inician una nueva infección. [52] [53] [54] Si se confirma, la transmisión por aerosoles tiene implicaciones de bioseguridad porque una preocupación importante asociada con el riesgo de trabajar con virus emergentes en el laboratorio es la generación de aerosoles a partir de diversas actividades de laboratorio que no son inmediatamente reconocibles y pueden afectar otro personal científico. [55] El contacto indirecto a través de superficies contaminadas es otra posible causa de infección. [56] Las investigaciones preliminares indican que el virus puede permanecer viable en plástico ( polipropileno ) y acero inoxidable ( AISI 304 ) hasta tres días, pero no sobrevive en cartón durante más de un día ni en cobre durante más de cuatro horas. . [10] El virus se inactiva con jabón, lo que desestabiliza su bicapa lipídica . [57] [58] También se ha encontrado ARN viral en muestras de heces y semen de personas infectadas. [59] [60]

El grado en que el virus es infeccioso durante el período de incubación es incierto, pero las investigaciones han indicado que la faringe alcanza la carga viral máxima aproximadamente cuatro días después de la infección [61] [62] o en la primera semana de síntomas y disminuye posteriormente. [63] La duración de la eliminación del ARN del SARS-CoV-2 es generalmente de 3 a 46 días después de la aparición de los síntomas. [64]

Un estudio realizado por un equipo de investigadores de la Universidad de Carolina del Norte encontró que la cavidad nasal es aparentemente el sitio inicial dominante de infección, con la posterior siembra del virus mediada por aspiración en los pulmones en la patogénesis del SARS-CoV-2. [65] Descubrieron que había un gradiente de infección desde alto en proximal hacia bajo en cultivos epiteliales pulmonares distales, con una infección focal en células ciliadas y neumocitos tipo 2 en las vías respiratorias y las regiones alveolares, respectivamente. [sesenta y cinco]

Los estudios han identificado una variedad de animales (como gatos, hurones, hámsteres, primates no humanos, visones, musarañas, perros mapaches, murciélagos frugívoros y conejos) que son susceptibles y permisivos a la infección por SARS-CoV-2. [66] [67] [68] Algunas instituciones han aconsejado que las personas infectadas con SARS-CoV-2 restrinjan su contacto con animales. [69] [70]

Transmisión asintomática y presintomática.

El 1 de  febrero de 2020, la Organización Mundial de la Salud (OMS) indicó que "la transmisión a partir de casos asintomáticos probablemente no sea un factor importante de transmisión". [71] Un metanálisis encontró que el 17% de las infecciones son asintomáticas y que las personas asintomáticas tenían un 42% menos de probabilidades de transmitir el virus. [72]

Sin embargo, un modelo epidemiológico del inicio del brote en China sugirió que " la diseminación presintomática puede ser típica entre las infecciones documentadas" y que las infecciones subclínicas pueden haber sido la fuente de la mayoría de las infecciones. [73] Eso puede explicar cómo de 217 a bordo de un crucero que atracó en Montevideo , sólo 24 de 128 que dieron positivo por ARN viral mostraron síntomas. [74] De manera similar, un estudio de noventa y cuatro pacientes hospitalizados en enero y febrero de 2020 estimó que los pacientes comenzaron a eliminar el virus dos o tres días antes de que aparecieran los síntomas y que "una proporción sustancial de la transmisión probablemente ocurrió antes de los primeros síntomas en el caso índice ". [53] Más tarde, los autores publicaron una corrección que mostraba que la muda comenzó antes de lo estimado inicialmente, de cuatro a cinco días antes de que aparecieran los síntomas. [75]

Reinfección

Existe incertidumbre sobre la reinfección y la inmunidad a largo plazo. [76] No se sabe qué tan común es la reinfección, pero los informes han indicado que ocurre con gravedad variable. [76]

El primer caso notificado de reinfección fue el de un hombre de 33 años de Hong Kong que dio positivo por primera vez el 26 de marzo de 2020, fue dado de alta el 15 de abril de 2020 después de dos pruebas negativas y volvió a dar positivo el 15 de agosto de 2020 (142 días después). , que fue confirmado mediante secuenciación del genoma completo que muestra que los genomas virales entre los episodios pertenecen a diferentes clados . [77] Los hallazgos tuvieron las implicaciones de que la inmunidad colectiva puede no eliminar el virus si la reinfección no es un hecho infrecuente y que las vacunas pueden no ser capaces de proporcionar protección de por vida contra el virus. [77]

Otro estudio de caso describió a un hombre de 25 años de Nevada que dio positivo por SARS-CoV-2 el 18 de abril de 2020 y el 5 de junio de 2020 (separados por dos pruebas negativas). Dado que los análisis genómicos mostraron diferencias genéticas significativas entre la variante del SARS-CoV-2 muestreada en esas dos fechas, los autores del estudio de caso determinaron que se trataba de una reinfección. [78] La segunda infección del hombre fue sintomáticamente más grave que la primera, pero se desconocen los mecanismos que podrían explicar esto. [78]

Embalse y origen

Transmisión de SARS-CoV-1 y SARS-CoV-2 de mamíferos como portadores biológicos a humanos

No se ha identificado ningún reservorio natural del SARS-CoV-2. [79] Antes de la aparición del SARS-CoV-2 como patógeno que infecta a los humanos, hubo dos epidemias de coronavirus basadas en zoonosis , las causadas por el SARS-CoV-1 y el MERS-CoV . [18]

Las primeras infecciones conocidas por SARS‑CoV‑2 se descubrieron en Wuhan, China. [80] La fuente original de transmisión viral a los humanos sigue sin estar clara, al igual que si el virus se volvió patógeno antes o después del evento de contagio . [9] [20] [81] Debido a que muchos de los primeros infectados eran trabajadores del mercado de mariscos de Huanan , [82] [83] se ha sugerido que el virus podría haberse originado en el mercado. [9] [84] Sin embargo, otras investigaciones indican que los visitantes pueden haber introducido el virus en el mercado, lo que luego facilitó la rápida expansión de las infecciones. [20] [85] Un informe convocado por la OMS en marzo de 2021 declaró que el contagio humano a través de un huésped animal intermediario era la explicación más probable, siendo el siguiente más probable el contagio directo de los murciélagos. La introducción a través de la cadena de suministro de alimentos y el mercado de mariscos de Huanan se consideró otra explicación posible, pero menos probable. [86] Sin embargo, un análisis realizado en noviembre de 2021 decía que el caso más antiguo conocido había sido identificado erróneamente y que la preponderancia de los primeros casos relacionados con el mercado de Huanan justificaba que él fuera la fuente. [87]

Para un virus adquirido recientemente mediante transmisión entre especies, se espera una rápida evolución. [88] La tasa de mutación estimada a partir de los primeros casos de SARS-CoV-2 fue de6,54 × 10 −4 por sitio por año. [86] Los coronavirus en general tienen una alta plasticidad genética , [89] pero la evolución viral del SARS-CoV-2 se ve ralentizada por la capacidad de corrección del ARN de su maquinaria de replicación. [90] A modo de comparación, se ha descubierto que la tasa de mutación viral in vivo del SARS-CoV-2 es más baja que la de la influenza. [91]

La investigación sobre el reservorio natural del virus que causó el brote de SARS de 2002-2004 ha dado como resultado el descubrimiento de muchos coronavirus de murciélago similares al SARS , la mayoría originados en murciélagos de herradura . La coincidencia más cercana, con diferencia, publicada en la revista Nature en febrero de 2022, fueron los virus BANAL-52 (96,8% de parecido con el SARS-CoV-2), BANAL-103 y BANAL-236, recolectados en tres especies diferentes de murciélagos en Feuang. , Laos. [92] [93] [94] Una fuente anterior publicada en febrero de 2020 identificó el virus RaTG13 , recolectado en murciélagos en Mojiang , Yunnan, China, como el más cercano al SARS-CoV-2, con un 96,1 % de parecido. [80] [95] Ninguno de los anteriores es su antepasado directo. [96]

Las muestras tomadas de Rhinolophus sinicus , una especie de murciélago de herradura , muestran un 80% de parecido con el SARS-CoV-2.

Se considera que los murciélagos son el reservorio natural más probable del SARS-CoV-2. [86] [97] Las diferencias entre el coronavirus de murciélago y el SARS-CoV-2 sugieren que los humanos pueden haber sido infectados a través de un huésped intermediario; [84] aunque la fuente de introducción en humanos sigue siendo desconocida. [98] [79]

Aunque inicialmente se postuló el papel de los pangolines como huésped intermedio (un estudio publicado en julio de 2020 sugirió que los pangolines son un huésped intermedio de coronavirus similares al SARS-CoV-2 [99] [100] ), estudios posteriores no han fundamentado su contribución. al desbordamiento. [86] La evidencia en contra de esta hipótesis incluye el hecho de que las muestras del virus del pangolín están demasiado distantes del SARS-CoV-2: los aislados obtenidos de pangolines incautados en Guangdong eran solo un 92% idénticos en secuencia al genoma del SARS-CoV-2 (coincidencias superiores al 90 El porcentaje puede parecer alto, pero en términos genómicos es una amplia brecha evolutiva [101] ). Además, a pesar de las similitudes en algunos aminoácidos críticos, [102] las muestras del virus del pangolín exhiben una unión deficiente al receptor ACE2 humano. [103]

Filogenética y taxonomía.

El SARS‑CoV‑2 pertenece a la amplia familia de virus conocidos como coronavirus . [28] Es un virus de ARN monocatenario (+ssRNA) de sentido positivo, con un único segmento de ARN lineal. Los coronavirus infectan a humanos, otros mamíferos, incluido el ganado y los animales de compañía, y especies de aves. [104] Los coronavirus humanos son capaces de causar enfermedades que van desde el resfriado común hasta enfermedades más graves como el síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS, tasa de mortalidad ~34%). El SARS-CoV-2 es el séptimo coronavirus conocido que infecta a las personas, después del 229E , NL63 , OC43 , HKU1 , MERS-CoV y el SARS-CoV original . [105]

Al igual que el coronavirus relacionado con el SARS implicado en el brote de SARS de 2003, el SARS-CoV-2 es miembro del subgénero Sarbecovirus ( linaje B beta-CoV ). [106] [107] Los coronavirus sufren recombinaciones frecuentes. [108] El mecanismo de recombinación en virus de ARN no segmentados como el SARS-CoV-2 es generalmente mediante replicación por elección de copia, en la que el material genético cambia de una molécula plantilla de ARN a otra durante la replicación. [109] La secuencia de ARN del SARS-CoV-2 tiene aproximadamente 30 000 bases de longitud, [110] relativamente larga para un coronavirus, que a su vez porta los genomas más grandes entre todas las familias de ARN. [111] Su genoma consiste casi en su totalidad en secuencias codificadoras de proteínas, un rasgo compartido con otros coronavirus. [108]

Micrografía de partículas del virus SARS‑CoV‑2 aisladas de un paciente
Micrografía electrónica de transmisión de viriones del SARS‑CoV‑2 (rojo) aislados de un paciente durante la pandemia de COVID-19

Una característica distintiva del SARS-CoV-2 es su incorporación de un sitio polibásico escindido por furina , [102] [112] que parece ser un elemento importante que mejora su virulencia. [113] Se sugirió que la adquisición del sitio de escisión de furina en la proteína S del SARS-CoV-2 era esencial para la transferencia zoonótica a humanos. [114] La furina proteasa reconoce la secuencia peptídica canónica R X[ R / K ] R ↓X donde el sitio de escisión se indica mediante una flecha hacia abajo y X es cualquier aminoácido . [115] [116] En el SARS-CoV-2, el sitio de reconocimiento está formado por la secuencia de nucleótidos de 12 codones incorporada CCT CGG CGG GCA que corresponde a la secuencia de aminoácidos PRR A. [117] Esta secuencia está aguas arriba de una arginina y serina que forma el sitio de escisión S1/S2 ( P RR A R ↓ S ) de la proteína de pico. [118] Aunque estos sitios son una característica común de origen natural de otros virus dentro de la subfamilia Orthocoronavirinae, [117] aparece en algunos otros virus del género Beta-CoV , [119] y es único entre los miembros de su subgénero por tal sitio. [102] El sitio de escisión de furina PRRAR↓ es muy similar al del coronavirus felino , una cepa de alfacoronavirus 1 . [120]

Los datos de la secuencia genética viral pueden proporcionar información crítica sobre si es probable que los virus separados por el tiempo y el espacio estén vinculados epidemiológicamente. [121] Con un número suficiente de genomas secuenciados , es posible reconstruir un árbol filogenético de la historia de mutaciones de una familia de virus. Hasta el 12 de enero de 2020, se habían aislado cinco genomas del SARS-CoV-2 en Wuhan y el Centro para el Control y la Prevención de Enfermedades (CCDC) de China y otras instituciones habían informado de ello; [110] [122] el número de genomas aumentó a 42 el 30 de enero de 2020. [123] Un análisis filogenético de esas muestras mostró que estaban "altamente relacionados con como máximo siete mutaciones relativas a un ancestro común ", lo que implica que el primer ser humano La infección se produjo en noviembre o diciembre de 2019. [123] El examen de la topología del árbol filogenético al comienzo de la pandemia también encontró grandes similitudes entre los aislamientos humanos. [124] Al 21 de agosto de 2021, estaban disponibles públicamente 3.422 genomas de SARS-CoV-2, pertenecientes a 19 cepas, muestreados en todos los continentes excepto la Antártida. [125]

El 11 de febrero de 2020, el Comité Internacional de Taxonomía de Virus anunció que, según las reglas existentes que computan relaciones jerárquicas entre coronavirus basadas en cinco secuencias conservadas de ácidos nucleicos, las diferencias entre el entonces llamado 2019-nCoV y el virus del SARS de 2003 brote fueron insuficientes para separarlas de especies virales . Por lo tanto, identificaron 2019-nCoV como un virus del coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio agudo severo . [126]

En julio de 2020, los científicos informaron que una variante más infecciosa del SARS-CoV-2 con la variante de proteína de pico G614 había reemplazado a la D614 como forma dominante en la pandemia. [127] [128]

Los genomas y subgenomas del coronavirus codifican seis marcos de lectura abiertos (ORF). [129] En octubre de 2020, los investigadores descubrieron un posible gen superpuesto llamado ORF3d , en el genoma del SARS-CoV-2 . Se desconoce si la proteína producida por ORF3d tiene alguna función, pero provoca una fuerte respuesta inmune. ORF3d ha sido identificado antes, en una variante del coronavirus que infecta a los pangolines . [130] [131]

árbol filogenético

Un árbol filogenético basado en secuencias del genoma completo del SARS-CoV-2 y coronavirus relacionados es: [132] [133]


Variantes

Micrografía electrónica de transmisión en falso color de una variante del coronavirus B.1.1.7. Se cree que la mayor transmisibilidad de la variante se debe a cambios en la estructura de las proteínas de pico, que se muestran aquí en verde.

Hay miles de variantes del SARS-CoV-2, que pueden agruparse en clados mucho más grandes . [142] Se han propuesto varias nomenclaturas de clados diferentes. Nextstrain divide las variantes en cinco clados (19A, 19B, 20A, 20B y 20C), mientras que GISAID las divide en siete (L, O, V, S, G, GH y GR). [143]

A finales de 2020 surgieron varias variantes notables del SARS-CoV-2. Actualmente, la Organización Mundial de la Salud ha declarado cinco variantes preocupantes , que son las siguientes: [144]

Otras variantes notables incluyen otras seis variantes designadas por la OMS que están bajo investigación y el Grupo 5 , que surgió entre los visones en Dinamarca y resultó en una campaña de eutanasia de visones que los dejó prácticamente extintos. [145]

Virología

Estructura del virus

Figura de un virión esférico del SARSr-CoV que muestra las ubicaciones de las proteínas estructurales que forman la envoltura viral y la nucleocápside interna.
Estructura de un virión SARSr-CoV

Cada virión del SARS-CoV-2 tiene entre 60 y 140 nanómetros (2,4 × 10 −6 –5,5 × 10 −6  pulgadas) de diámetro; [105] [83] su masa dentro de la población humana mundial se ha estimado entre 0,1 y 10 kilogramos. [146] Al igual que otros coronavirus, el SARS-CoV-2 tiene cuatro proteínas estructurales, conocidas como proteínas S ( espiga ), E ( envoltura ), M ( membrana ) y N ( nucleocápside ); la proteína N contiene el genoma de ARN y las proteínas S, E y M juntas crean la envoltura viral . [147] Las proteínas S del coronavirus son glicoproteínas y también proteínas de membrana de tipo I (membranas que contienen un único dominio transmembrana orientado en el lado extracelular). [114] Se dividen en dos partes funcionales (S1 y S2). [104] En el SARS-CoV-2, la proteína de pico, de la que se han obtenido imágenes a nivel atómico mediante microscopía electrónica criogénica , [148] [149] es la proteína responsable de permitir que el virus se adhiera y se fusione con la membrana de una célula huésped; [147] específicamente, su subunidad S1 cataliza la unión, la fusión de la subunidad S2. [150]

Homotrímero de pico de SARS-CoV-2 que se centra en una subunidad de proteína con un dominio de unión ACE2 resaltado
Homotrímero de pico de SARS‑CoV‑2 con una subunidad proteica resaltada. El dominio de unión ACE2 es magenta.

genoma

A principios de 2022, se habían secuenciado y depositado en bases de datos públicas alrededor de 7 millones de genomas del SARS-CoV-2 y cada mes se añadían aproximadamente otros 800.000. [151] En septiembre de 2023, la base de datos GISAID EpiCoV contenía más de 16 millones de secuencias del genoma. [152]

El SARS-CoV-2 tiene un genoma de ARN monocatenario lineal, de sentido positivo , de aproximadamente 30.000 bases de largo. [104] Su genoma tiene un sesgo contra los nucleótidos de citosina (C) y guanina (G) , como otros coronavirus. [153] El genoma tiene la composición más alta de U (32,2%), seguida de A (29,9%) y una composición similar de G (19,6%) y C (18,3%). [154] El sesgo de nucleótidos surge de la mutación de guaninas y citosinas a adenosinas y uracilos , respectivamente. [155] Se cree que la mutación de los dinucleótidos CG surge para evitar el mecanismo de defensa de las células relacionado con la proteína antiviral del dedo de zinc , [156] y para reducir la energía para desvincular el genoma durante la replicación y traducción ( el par de bases de adenosina y uracilo a través de dos átomos de hidrógeno) . enlaces , citosina y guanina a través de tres). [155] El agotamiento de los dinucleótidos CG en su genoma ha llevado al virus a tener un sesgo notable en el uso de codones . Por ejemplo, los seis codones diferentes de la arginina tienen un uso relativo de codones sinónimos de AGA (2,67), CGU (1,46), AGG (0,81), CGC (0,58), CGA (0,29) y CGG (0,19). [154] Se observa una tendencia similar de sesgo en el uso de codones en otros coronavirus relacionados con el SARS. [157]

Ciclo de replicación

Las infecciones virales comienzan cuando las partículas virales se unen a los receptores celulares de la superficie del huésped. [158] Los experimentos de modelado de proteínas en la proteína de pico del virus pronto sugirieron que el SARS-CoV-2 tiene suficiente afinidad con el receptor de la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) en las células humanas para usarlos como mecanismo de entrada celular . [159] El 22 de enero de 2020, un grupo en China que trabajaba con el genoma completo del virus y un grupo en los Estados Unidos que utilizaba métodos de genética inversa demostraron de forma independiente y experimental que ACE2 podría actuar como receptor del SARS-CoV-2. [80] [160] [161] [162] Los estudios han demostrado que el SARS-CoV-2 tiene una mayor afinidad por la ACE2 humana que el virus del SARS original. [148] [163] El SARS-CoV-2 también puede utilizar basigina para ayudar en la entrada a las células. [164]

El cebado inicial de la proteína de pico mediante proteasa transmembrana, serina 2 (TMPRSS2) es esencial para la entrada del SARS-CoV-2. [25] La proteína huésped neuropilina 1 (NRP1) puede ayudar al virus a ingresar a la célula huésped utilizando ACE2. [165] Después de que un virión del SARS-CoV-2 se adhiere a una célula objetivo, el TMPRSS2 de la célula abre la proteína de pico del virus, exponiendo un péptido de fusión en la subunidad S2 y el receptor ACE2 del huésped. [150] Después de la fusión, se forma un endosoma alrededor del virión, separándolo del resto de la célula huésped. El virión escapa cuando el pH del endosoma desciende o cuando la catepsina , una cisteína proteasa del huésped, lo escinde. [150] Luego, el virión libera ARN en la célula y la obliga a producir y diseminar copias del virus , que infectan más células. [166]

El SARS-CoV-2 produce al menos tres factores de virulencia que promueven la liberación de nuevos viriones de las células huésped e inhiben la respuesta inmune . [147] Aún se está investigando si incluyen la regulación negativa de ACE2, como se observa en coronavirus similares (a partir de mayo de 2020). [167]

Micrografías electrónicas de barrido coloreadas digitalmente de viriones del SARS-CoV-2 (amarillo) que emergen de células humanas cultivadas en un laboratorio

Tratamiento y desarrollo de fármacos.

Se sabe que muy pocos fármacos inhiben eficazmente el SARS-CoV-2. Masitinib es un fármaco clínicamente seguro y recientemente se descubrió que inhibe su proteasa principal , 3CLpro, y mostró una reducción >200 veces en los títulos virales en los pulmones y la nariz en ratones. Sin embargo, no está aprobado para el tratamiento de COVID-19 en humanos a partir de agosto de 2021. [168] [ necesita actualización ] En diciembre de 2021, Estados Unidos otorgó autorización de uso de emergencia a Nirmatrelvir/ritonavir para el tratamiento del virus; [169] La Unión Europea , el Reino Unido y Canadá hicieron lo mismo con plena autorización poco después. [170] [171] [172] Un estudio encontró que Nirmatrelvir/ritonavir redujo el riesgo de hospitalización y muerte en un 88%. [173]

COVID Moonshot es un proyecto colaborativo internacional de ciencia abierta iniciado en marzo de 2020 con el objetivo de desarrollar un fármaco antiviral oral no patentado para el tratamiento del SARS-CoV-2. [174]

Epidemiología

Las pruebas retrospectivas recopiladas dentro del sistema de vigilancia chino no revelaron indicios claros de una circulación sustancial no reconocida del SARS-CoV-2 en Wuhan durante la última parte de 2019. [86]

Un metaanálisis de noviembre de 2020 estimó que el número de reproducción básico ( ) del virus estaba entre 2,39 y 3,44. [21] Esto significa que se espera que cada infección por el virus produzca entre 2,39 y 3,44 nuevas infecciones cuando ningún miembro de la comunidad sea inmune y no se tomen medidas preventivas . El número de reproducción puede ser mayor en condiciones densamente pobladas como las que se encuentran en los cruceros . [175] El comportamiento humano afecta el valor de R0 y, por lo tanto, las estimaciones de R0 difieren entre diferentes países, culturas y normas sociales. Por ejemplo, un estudio encontró un R0 relativamente bajo (~3,5) en Suecia, Bélgica y los Países Bajos, mientras que España y Estados Unidos tenían valores de R0 significativamente más altos (5,9 a 6,4, respectivamente). [176]

Ha habido alrededor de 96.000 casos confirmados de infección en China continental. [180] Si bien la proporción de infecciones que resultan en casos confirmados o progresan hacia una enfermedad diagnosticable sigue sin estar clara, [181] un modelo matemático estimó que 75.815 personas estaban infectadas el 25 de enero de 2020 solo en Wuhan, en un momento en que el número de casos confirmados en todo el mundo fue sólo 2.015. [182] Antes del 24 de febrero de 2020, más del 95% de todas las muertes por COVID-19 en todo el mundo habían ocurrido en la provincia de Hubei , donde se encuentra Wuhan. [183] ​​[184] Al 10 de marzo de 2023, el porcentaje había disminuido al 0,047%. [180]

Al 10 de marzo de 2023, había un total de 676.609.955 casos confirmados de infección por SARS-CoV-2. [180] El número total de muertes atribuidas al virus fue de 6.881.955. [180]

Ver también

Referencias

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  2. ^ ab Grupo de estudio Coronaviridae del Comité Internacional sobre Taxonomía de Virus (abril de 2020). "La especie coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio agudo severo: clasificar 2019-nCoV y denominarlo SARS-CoV-2". Microbiología de la naturaleza . 5 (4): 536–544. doi :10.1038/s41564-020-0695-z. PMC 7095448 . PMID  32123347. 
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