En biología molecular , un dominio de dedo RING (abreviatura de R eally Interesting New G ene ) es un dominio estructural proteico de tipo dedo de zinc que contiene un motivo de aminoácido C 3 HC 4 que se une a dos cationes de zinc (siete cisteínas y una histidina) . ordenados de forma no consecutiva). [2] [3] [4] [5] Este dominio proteico contiene de 40 a 60 aminoácidos. Muchas proteínas que contienen un dedo ANILLO desempeñan un papel clave en la vía de ubiquitinación .
Los dominios de dedos de zinc (Znf) son motivos proteicos relativamente pequeños que se unen a uno o más átomos de zinc y que generalmente contienen múltiples protuberancias en forma de dedos que establecen contactos en tándem con su molécula objetivo. Se unen a sustratos de ADN , ARN , proteínas y/o lípidos . [6] [7] [8] [9] [10] Sus propiedades de unión dependen de la secuencia de aminoácidos de los dominios de los dedos y del conector entre los dedos, así como de las estructuras de orden superior y del número de dedos. Los dominios Znf se encuentran a menudo en grupos, donde los dedos pueden tener diferentes especificidades de unión. Hay muchas superfamilias de motivos Znf, que varían tanto en secuencia como en estructura. Muestran una considerable versatilidad en los modos de unión, incluso entre miembros de la misma clase (por ejemplo, algunos se unen al ADN, otros a proteínas), lo que sugiere que los motivos Znf son estructuras estables que han desarrollado funciones especializadas. Por ejemplo, las proteínas que contienen Znf funcionan en la transcripción y traducción de genes, el tráfico de ARNm, la organización del citoesqueleto , el desarrollo epitelial, la adhesión celular , el plegamiento de proteínas , la remodelación de la cromatina y la detección de zinc. [11] Los motivos de unión a zinc son estructuras estables y rara vez sufren cambios conformacionales al unirse a su objetivo.
Algunos dominios de dedos de Zn han divergido de tal manera que aún mantienen su estructura central, pero han perdido su capacidad para unirse al zinc, utilizando otros medios como puentes salinos o uniéndose a otros metales para estabilizar los pliegues en forma de dedos.
Muchos dominios de dedos RING se unen simultáneamente a enzimas de ubiquitinación y sus sustratos y, por lo tanto, funcionan como ligasas . La ubiquitinación, a su vez, se dirige a la proteína sustrato para su degradación. [12] [13] [14]
El dominio de dedo RING tiene la secuencia consenso C -X 2 - C -X [9-39] - C -X [1-3] - H -X [2-3] - C -X 2 - C -X [4 -48] - C -X 2 - C . [2] donde:
La siguiente es una representación esquemática de la estructura del dominio de dedo RING: [2]
xxxxxx xxxx xxxx xxxx CCCC x\/xx\/x x Zn xx Zn x C/\HC/\C xxxx xxxxxxxxxxxxxxx
Ejemplos de genes humanos que codifican proteínas que contienen un dominio de dedo RING incluyen:
AMFR , BARD1 , BBAP , BFAR, BIRC2 , BIRC3 , BIRC7 , BIRC8, BMI1 , BRAP , BRCA1 , CBL , CBLB , CBLC , CBLL1 , CHFR , CNOT4 , COMMD3, DTX1 , DTX2 , DTX3 , DTX3L , DTX4 , DZIP3 , HCGV , HLTF , HOIL-1 , IRF2BP2 , LNX1 , LNX2, LONRF1, LONRF2, LONRF3, MARZO1, MARZO10, MARZO2 , MARZO3, MARZO4, MARZO5 , MARZO6 , MARZO7 , MARZO8, MARZO9, MDM2 , MEX3A, MEX3B , MEX3C, MEX3D , MGRN1, MIB1 , MID1 , MID2 , MKRN1, MKRN2, MKRN3 , MKRN4, MNAT1 , MYLIP , NFX1 , NFX2, PCGF1 , PCGF2 , PCGF3, PCGF4 , PCGF5 , PCGF6 , PDZRN3 , PDZRN4, PEX10 , PHRF1, PJA1 , PJA2 , PML , PML- RAR, PXMP3 , RAD18 , RAG1 , RAPSN , RBCK1 , RBX1 , RC3H1 , RC3H2, RCHY1 , RFP2, RFPL1, RFPL2, RFPL3, RFPL4B , RFWD2 , RFWD3, RING1 , RNF2 , RNF4 , RNF5 , RNF6, RNF7 , RNF8 , RNF10 , RNF11 , RNF12 , RNF13 , RNF14 , RNF19A , RNF20 , RNF24 , RNF25 , RNF26 , RNF32 , RNF38 , RNF39 , RNF40 , RNF41 , RNF43 , RNF44, RNF55 , RNF71 , RNF103,RNF111 , RNF113A , RNF113B, RNF121, RNF122 , RNF123 , RNF125 , RNF126, RNF128 , RNF130, RNF133, RNF135, RNF138 , RNF139 , RNF141 , RNF144A , RNF145, RNF146. 148, RNF149, RNF150, RNF151 , RNF152, RNF157 , RNF165, RNF166, RNF167, RNF168, RNF169, RNF170, RNF175, RNF180, RNF181, RNF182, RNF185, RNF207, RNF213, RNF215 , RNFT1, SH3MD4, SH3RF1 , SH3RF2, SYVN1 , TIF1, TMEM118, TOPORS , TRAF2 , TRAF3 , TRAF4 , TRAF5 , TRAF6 , TRAF7, TRAIP , TRIM2, TRIM3, TRIM4 , TRIM5, TRIM6 , TRIM7 , TRIM8, TRIM9, TRIM10, TRIM11 , TRIM13 , TRIM15, TRIM17 , TRIM21, TRIM22 , TRIM23 , TRIM24 , TRIM25 , TRIM26 , TRIM27 , TRIM28 , TRIM31 , TRIM32 , TRIM33 , TRIM34, TRIM35, TRIM36, TRIM38, TRIM39 , TRIM40, TRIM41, TRIM42, TRIM43, TRIM45 , TRIM46 , TRIM47, TRIM48, TRIM49, TRIM50, TRIM52, TRIM54 , TRIM55 , TRIM56 , TRIM58, TRIM60, TRIM61, TRIM62 , TRIM63 , TRIM65, TRIM67, TRIM68 , TRIM69 , TRIM71, TRIM72, TRIM73, TRIM74, TRIML1, TTC3 , UHRF1 , UHRF2 , VPS11 , VPS8, ZNF179, ZNF294, ZNF313 , ZNF364 , ZNF451 . , ZNFB7, ZNRF1 , ZNRF2, ZNRF3, ZNRF4 y ZSWIM2.