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Dominio del dedo ANILLO

En biología molecular , un dominio de dedo RING (abreviatura de R eally Interesting New G ene ) es un dominio estructural proteico de tipo dedo de zinc que contiene un motivo de aminoácido C 3 HC 4 que se une a dos cationes de zinc (siete cisteínas y una histidina) . ordenados de forma no consecutiva). [2] [3] [4] [5] Este dominio proteico contiene de 40 a 60 aminoácidos. Muchas proteínas que contienen un dedo ANILLO desempeñan un papel clave en la vía de ubiquitinación .

Dedos de zinc

Los dominios de dedos de zinc (Znf) son motivos proteicos relativamente pequeños que se unen a uno o más átomos de zinc y que generalmente contienen múltiples protuberancias en forma de dedos que establecen contactos en tándem con su molécula objetivo. Se unen a sustratos de ADN , ARN , proteínas y/o lípidos . [6] [7] [8] [9] [10] Sus propiedades de unión dependen de la secuencia de aminoácidos de los dominios de los dedos y del conector entre los dedos, así como de las estructuras de orden superior y del número de dedos. Los dominios Znf se encuentran a menudo en grupos, donde los dedos pueden tener diferentes especificidades de unión. Hay muchas superfamilias de motivos Znf, que varían tanto en secuencia como en estructura. Muestran una considerable versatilidad en los modos de unión, incluso entre miembros de la misma clase (por ejemplo, algunos se unen al ADN, otros a proteínas), lo que sugiere que los motivos Znf son estructuras estables que han desarrollado funciones especializadas. Por ejemplo, las proteínas que contienen Znf funcionan en la transcripción y traducción de genes, el tráfico de ARNm, la organización del citoesqueleto , el desarrollo epitelial, la adhesión celular , el plegamiento de proteínas , la remodelación de la cromatina y la detección de zinc. [11] Los motivos de unión a zinc son estructuras estables y rara vez sufren cambios conformacionales al unirse a su objetivo.

Algunos dominios de dedos de Zn han divergido de tal manera que aún mantienen su estructura central, pero han perdido su capacidad para unirse al zinc, utilizando otros medios como puentes salinos o uniéndose a otros metales para estabilizar los pliegues en forma de dedos.

Función

Muchos dominios de dedos RING se unen simultáneamente a enzimas de ubiquitinación y sus sustratos y, por lo tanto, funcionan como ligasas . La ubiquitinación, a su vez, se dirige a la proteína sustrato para su degradación. [12] [13] [14]

Estructura

El dominio de dedo RING tiene la secuencia consenso C -X 2 - C -X [9-39] - C -X [1-3] - H -X [2-3] - C -X 2 - C -X [4 -48] - C -X 2 - C . [2] donde:

La siguiente es una representación esquemática de la estructura del dominio de dedo RING: [2]

 xxxxxx xxxx xxxx xxxx CCCC x\/xx\/x x Zn xx Zn x C/\HC/\C xxxx xxxxxxxxxxxxxxx

Ejemplos

Ejemplos de genes humanos que codifican proteínas que contienen un dominio de dedo RING incluyen:

AMFR , BARD1 , BBAP , BFAR, BIRC2 , BIRC3 , BIRC7 , BIRC8, BMI1 , BRAP , BRCA1 , CBL , CBLB , CBLC , CBLL1 , CHFR , CNOT4 , COMMD3, DTX1 , DTX2 , DTX3 , DTX3L , DTX4 , DZIP3 , HCGV , HLTF , HOIL-1 , IRF2BP2 , LNX1 , LNX2, LONRF1, LONRF2, LONRF3, MARZO1, MARZO10, MARZO2 , MARZO3, MARZO4, MARZO5 , MARZO6 , MARZO7 , MARZO8, MARZO9, MDM2 , MEX3A, MEX3B , MEX3C, MEX3D , MGRN1, MIB1 , MID1 , MID2 , MKRN1, MKRN2, MKRN3 , MKRN4, MNAT1 , MYLIP , NFX1 , NFX2, PCGF1 , PCGF2 , PCGF3, PCGF4 , PCGF5 , PCGF6 , PDZRN3 , PDZRN4, PEX10 , PHRF1, PJA1 , PJA2 , PML , PML- RAR, PXMP3 , RAD18 , RAG1 , RAPSN , RBCK1 , RBX1 , RC3H1 , RC3H2, RCHY1 , RFP2, RFPL1, RFPL2, RFPL3, RFPL4B , RFWD2 , RFWD3, RING1 , RNF2 , RNF4 , RNF5 , RNF6, RNF7 , RNF8 , RNF10 , RNF11 , RNF12 , RNF13 , RNF14 , RNF19A , RNF20 , RNF24 , RNF25 , RNF26 , RNF32 , RNF38 , RNF39 , RNF40 , RNF41 , RNF43 , RNF44, RNF55 , RNF71 , RNF103,RNF111 , RNF113A , RNF113B, RNF121, RNF122 , RNF123 , RNF125 , RNF126, RNF128 , RNF130, RNF133, RNF135, RNF138 , RNF139 , RNF141 , RNF144A , RNF145, RNF146. 148, RNF149, RNF150, RNF151 , RNF152, RNF157 , RNF165, RNF166, RNF167, RNF168, RNF169, RNF170, RNF175, RNF180, RNF181, RNF182, RNF185, RNF207, RNF213, RNF215 , RNFT1, SH3MD4, SH3RF1 , SH3RF2, SYVN1 , TIF1, TMEM118, TOPORS , TRAF2 , TRAF3 , TRAF4 , TRAF5 , TRAF6 , TRAF7, TRAIP , TRIM2, TRIM3, TRIM4 , TRIM5, TRIM6 , TRIM7 , TRIM8, TRIM9, TRIM10, TRIM11 , TRIM13 , TRIM15, TRIM17 , TRIM21, TRIM22 , TRIM23 , TRIM24 , TRIM25 , TRIM26 , TRIM27 , TRIM28 , TRIM31 , TRIM32 , TRIM33 , TRIM34, TRIM35, TRIM36, TRIM38, TRIM39 , TRIM40, TRIM41, TRIM42, TRIM43, TRIM45 , TRIM46 , TRIM47, TRIM48, TRIM49, TRIM50, TRIM52, TRIM54 , TRIM55 , TRIM56 , TRIM58, TRIM60, TRIM61, TRIM62 , TRIM63 , TRIM65, TRIM67, TRIM68 , TRIM69 , TRIM71, TRIM72, TRIM73, TRIM74, TRIML1, TTC3 , UHRF1 , UHRF2 , VPS11 , VPS8, ZNF179, ZNF294, ZNF313 , ZNF364 , ZNF451 . , ZNFB7, ZNRF1 , ZNRF2, ZNRF3, ZNRF4 y ZSWIM2.

Referencias

  1. ^ Barlow PN, Luisi B, Milner A, Elliott M, Everett R (marzo de 1994). "Estructura del dominio C3HC4 mediante espectroscopia de resonancia magnética nuclear 1H. Una nueva clase estructural de dedos de zinc". J. Mol. Biol . 237 (2): 201–11. doi :10.1006/jmbi.1994.1222. PMID  8126734.
  2. ^ abc Borden KL, Freemont PS (1996). "El dominio de dedo RING: un ejemplo reciente de una familia de estructura de secuencia". actual. Opinión. Estructura. Biol . 6 (3): 395–401. doi :10.1016/S0959-440X(96)80060-1. PMID  8804826.
  3. ^ Hanson IM, Poustka A, Trowsdale J (1991). "Nuevos genes en la región de clase II del complejo mayor de histocompatibilidad humano". Genómica . 10 (2): 417–24. doi :10.1016/0888-7543(91)90327-B. PMID  1906426.
  4. ^ Freemont PS, Hanson IM, Trowsdale J (1991). "Un nuevo motivo de secuencia rico en cisteína". Celúla . 64 (3): 483–4. doi : 10.1016/0092-8674(91)90229-R . PMID  1991318.
  5. ^ Lovering R, Hanson IM, Borden KL, Martin S, O'Reilly NJ, Evan GI, Rahman D, Pappin DJ, Trowsdale J, Freemont PS (1993). "Identificación y caracterización preliminar de un motivo proteico relacionado con el dedo de zinc". Proc. Nacional. Acad. Ciencia. EE.UU . 90 (6): 2112–6. Código bibliográfico : 1993PNAS...90.2112L. doi : 10.1073/pnas.90.6.2112 . PMC 46035 . PMID  7681583. 
  6. ^ Klug A (1999). "Péptidos con dedos de zinc para la regulación de la expresión genética". J. Mol. Biol . 293 (2): 215–8. doi :10.1006/jmbi.1999.3007. PMID  10529348.
  7. ^ Salón TM (2005). "Múltiples modos de reconocimiento de ARN por proteínas con dedos de zinc". actual. Opinión. Estructura. Biol . 15 (3): 367–73. doi :10.1016/j.sbi.2005.04.004. PMID  15963892.
  8. ^ Marrón RS (2005). "Proteínas con dedos de zinc: controlar el ARN". actual. Opinión. Estructura. Biol . 15 (1): 94–8. doi :10.1016/j.sbi.2005.01.006. PMID  15718139.
  9. ^ Gamsjaeger R, Liew CK, Loughlin FE, Crossley M, Mackay JP (2007). "Dedos pegajosos: dedos de zinc como motivos de reconocimiento de proteínas". Tendencias Bioquímica. Ciencia . 32 (2): 63–70. doi :10.1016/j.tibs.2006.12.007. PMID  17210253.
  10. ^ Matthews JM, Sunde M (2002). "Dedos de zinc: pliegues para muchas ocasiones". Vida IUBMB . 54 (6): 351–5. doi : 10.1080/15216540216035 . PMID  12665246. S2CID  22109146.
  11. ^ Laicos JH, Lee BM, Wright PE (2001). "Proteínas con dedos de zinc: nuevos conocimientos sobre la diversidad estructural y funcional". actual. Opinión. Estructura. Biol . 11 (1): 39–46. doi :10.1016/S0959-440X(00)00167-6. PMID  11179890.
  12. ^ Lorick KL, Jensen JP, Fang S, Ong AM, Hatakeyama S, Weissman AM (1999). "Los dedos RING median la ubiquitinación dependiente de la enzima conjugadora de ubiquitina (E2)". Proc. Nacional. Acad. Ciencia. EE.UU . 96 (20): 11364–9. Código bibliográfico : 1999PNAS...9611364L. doi : 10.1073/pnas.96.20.11364 . PMC 18039 . PMID  10500182. 
  13. ^ Joazeiro CA, Weissman AM (2000). "Proteínas de dedo RING: mediadores de la actividad de la ubiquitina ligasa". Celúla . 102 (5): 549–52. doi : 10.1016/S0092-8674(00)00077-5 . PMID  11007473.
  14. ^ Freemont PS (2000). "¿ANILLO para la destrucción?". actual. Biol . 10 (2): R84–7. doi : 10.1016/S0960-9822(00)00287-6 . PMID  10662664.

enlaces externos

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