Los juegos de la consola virtual pueden ser jugados utilizando tres controles distintos.Tecmo fue la primera compañía externa que lanzó un juego en la consola virtual (Solomon's Key de la NES).SNK Playmore ha anunciado la intención de lanzar la serie Samurai Shodown y algunos otros juegos para la consola virtual.Midway también tiene planes para llevar juegos clásicos de Mortal Kombat a la consola virtual.Entre las terceras empresas que confirmaron su apoyo a la consola virtual están: El mapeo de los botones en cada controlador utilizado en cada sistema es el siguiente:
El mando clásico que puede ser usado con todos los juegos de la consola virtual.
