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Richard M. Durbin

Richard Michael Durbin FRS [17] (nacido en 1960) [15] es un biólogo computacional británico [18] [19] [2] y profesor de genética Al-Kindi en la Universidad de Cambridge . [20] [21] [22] [23] También se desempeña como miembro asociado de la facultad en el Wellcome Sanger Institute , donde anteriormente fue líder de grupo senior. [24] [25] [26] [27]

Educación

Durbin se formó en The Hall School, Hampstead [ cita requerida ] y Highgate School en Londres. [15] Después de competir en la Olimpiada Internacional de Matemáticas de 1978/9 , [28] pasó a estudiar en la Universidad de Cambridge, donde se graduó en 1982 [29] con una licenciatura de segunda clase en el Cambridge Mathematical Tripos . Después de graduarse, continuó estudiando para obtener un doctorado [3] en St John's College, Cambridge [15] estudiando el desarrollo y la organización del sistema nervioso de Caenorhabditis elegans mientras trabajaba en el Laboratorio de Biología Molecular (LMB) en Cambridge, supervisado por John Graham White . [3]

Carrera e investigación

Los primeros trabajos de Durbin incluyeron el desarrollo del software del instrumento principal para uno de los primeros detectores de área de cristalografía de rayos X [30] y el microscopio confocal MRC Biorad , junto con contribuciones al modelado neuronal. [31] [32]

Posteriormente dirigió la informática para el proyecto del genoma de Caenorhabditis elegans [33] y, junto con Jean Thierry-Mieg, desarrolló la base de datos del genoma AceDB , que evolucionó hasta convertirse en el recurso web WormBase . Después de esto, desempeñó un papel importante en la recopilación de datos y la interpretación de la secuencia del genoma humano [34] .

Ha desarrollado numerosos métodos para el análisis computacional de secuencias . [35] [36] Estos incluyen la búsqueda de genes (por ejemplo, GeneWise) con Ewan Birney [37] y los modelos ocultos de Markov para la alineación y coincidencia de proteínas y ácidos nucleicos (por ejemplo, HMMER ) con Sean Eddy y Graeme Mitchison. Un libro de texto estándar Análisis de secuencias biológicas coescrito con Sean Eddy , Anders Krogh y Graeme Mitchison [16] describe parte de este trabajo. Utilizando estos métodos, Durbin trabajó con colegas para construir una serie de importantes recursos de datos genómicos, incluida la base de datos de la familia de proteínas Pfam , [38] la base de datos del genoma Ensembl , [39] y la base de datos de la familia de genes TreeFam . [9]

Más recientemente, Durbin ha vuelto a la secuenciación y ha desarrollado enfoques de baja cobertura para la secuenciación del genoma poblacional, aplicados primero a la levadura, [40] [41] y ha sido uno de los líderes en la aplicación de nueva tecnología de secuenciación para estudiar la variación del genoma humano. [42] [43] Durbin actualmente codirige el Proyecto internacional 1000 Genomas para caracterizar la variación hasta el 1% de frecuencia alélica como base para la genética humana.

Premios y honores

Durbin fue ganador conjunto del Premio Mullard de la Royal Society en 1994 (por su trabajo en el microscopio confocal ), ganó el Premio Lord Lloyd de Kilgerran de la Fundación para la Ciencia y la Tecnología en 2004, y fue elegido miembro de la Royal Society (FRS) en 2004 [17] y miembro de la Organización Europea de Biología Molecular (EMBO) en 2009. La Royal Society otorgó su Medalla Gabor a Durbin en 2017 por sus contribuciones a la biología computacional. [44] En 2023 recibió el Premio Internacional de Biología por su trabajo en la Biología de los Genomas.

El certificado de elección de Durbin para la Royal Society dice:

Durbin es reconocido por su poderosa contribución a la biología computacional. En particular, desempeñó un papel destacado en el establecimiento del nuevo campo de la bioinformática, que permite el manejo de datos biológicos a una escala sin precedentes, lo que permitió que la genómica prosperara. Lideró el análisis del genoma de C. elegans y, junto con Thierry-Mieg, desarrolló el software de base de datos AceDB . En el proyecto internacional del genoma, dirigió el análisis de genes codificadores de proteínas. Introdujo herramientas computacionales clave en el software y el manejo de datos. Su base de datos Pfam permitió la identificación de dominios en nuevas secuencias de proteínas ; utilizó modelos ocultos de Markov, a cuyo enfoque en general aportó rigor y que condujeron a modelos de covarianza para la secuencia de ARN . [45]

Vida personal

Durbin es hijo de James Durbin y está casado con Julie Ahringer , científica del Instituto Gurdon . Tienen dos hijos. [15]

Referencias

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