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Michael Ashburner

Michael Ashburner FRS MAE [11] (23 de mayo de 1942 - 7 de julio de 2023) fue un biólogo inglés y profesor del Departamento de Genética de la Universidad de Cambridge . [12] También fue codirector y cofundador del Instituto Europeo de Bioinformática (EBI) [13] del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL) [14] [15] y miembro del Churchill College, Cambridge . [16] [17]

Educación

Nacido en Brighton , Sussex, Inglaterra , [7] Ashburner asistió a la High Wycombe Royal Grammar School de 1953 a 1960. [6] Estudió en el Churchill College, Cambridge , [6] y recibió su Licenciatura en Artes en Ciencias Naturales Tripos (Genética) en 1964, su Doctorado supervisado por Alan Henderson [18] [5] del Departamento de Genética en 1968, y se le otorgó un Doctorado en Ciencias en 1978. [19]

Investigación y carrera

La mayor parte de la investigación de Ashburner se centró en el organismo modelo Drosophila melanogaster . [8] [20] [21] [22] [23] [24] [25] La carrera de Ashburner comenzó en el período temprano de la biología molecular, antes del desarrollo de la mayoría de las técnicas de ADN recombinante que se utilizan hoy en día, como el Northern/Southern/Western blotting. Sin embargo, al observar patrones de "soplado" en cromosomas politénicos , [20] estableció la existencia de una cascada de controles genéticos en el desarrollo postlarval desencadenado por la ecdisona . [26] El modelo de Ashburner de 1974 se convirtió en un paradigma para la regulación génica de los metazoos , en la misma medida en que el modelo de Jacob - Monod lo hizo para los procariotas. Ashburner colaboró ​​ampliamente y fue mentor de numerosos estudiantes de doctorado y estudiantes de investigación postdoctoral durante su carrera. [27] [28]

Ashburner también fue miembro del consorcio que finalmente secuenció y anotó el genoma de Drosophila melanogaster . Los recuerdos de Ashburner sobre la secuenciación del genoma de D. melanogaster forman la base de un libro titulado "Won for All: How the Drosophila Genome Was Sequenced" (Ganado para todos: cómo se secuenció el genoma de Drosophila). [29] [30] [31] [32] Un esfuerzo prolongado de su laboratorio para caracterizar la región Adh [21] resultó invaluable para validar las estrategias de anotación cuando se dispuso de información genómica a gran escala. Ashburner y sus colegas han recibido financiación del Consejo de Investigación en Biotecnología y Ciencias Biológicas (BBSRC) , el Consejo de Investigación Médica (MRC) [33] y el Consejo de Investigación en Ingeniería y Ciencias Físicas (EPSRC) [34] para sus estudios sobre la genómica de Drosophila aprovechando el genoma de D. melanogaster y su anotación.

Biología computacional

Ashburner también fue un pionero en la aplicación de las computadoras a la biología. Sus contribuciones incluyen su participación activa en la creación de FlyBase [10] y el desarrollo de Ontologías Biomédicas Abiertas [35] para permitir la anotación de información biológica mediante búsquedas automáticas, en particular la Ontología Genética [9] [36]

[37] y ChEBI . [38] Fue fundamental en el establecimiento del EBI, [39] así como en asegurar su ubicación en el Reino Unido, [19] y actuó como el primer jefe del EBI junto con Graham Cameron. [40]

Promoción de la ciencia abierta

Como parte de su participación en la secuenciación del genoma de D. melanogaster , Ashburner desempeñó un papel decisivo para garantizar que la secuencia y las anotaciones resultantes se pusieran a disposición del público. [29] Además, Ashburner defendió firmemente que el genoma humano publicado en Science en 2000 por Celera Genomics se pusiera a disposición del público de forma gratuita, [41] [42] [43] [44] y se manifestó repetidamente contra la privatización de los recursos genómicos. [44] [45] Ashburner también fue uno de los firmantes de la primera carta abierta a Science en 2001 pidiendo un repositorio centralizado y abierto de la literatura científica, [46] y posteriormente se convirtió en un firme defensor de la publicación de acceso abierto , [47] [48] hablando a favor de esta causa en la literatura científica [19] [49] y en los medios populares. [50] [51] [52] También proporcionó evidencia escrita al Comité Selecto de Ciencia y Tecnología del Parlamento del Reino Unido en apoyo de la publicación de acceso abierto [53] y formó parte del consejo asesor inicial de UK PubMed Central , [54] el primer sitio espejo global del repositorio PubMed Central de literatura biológica disponible de forma gratuita.

Premios y honores

Ashburner fue elegido Miembro Honorario Extranjero de la Academia Estadounidense de Artes y Ciencias en 1993. [55] Recibió la Medalla Gregor Mendel de la Academia de Ciencias de la República Checa en 1998, el primer Premio George W. Beadle [2] de la Sociedad de Genética de América en 1999, un Doctorado honorario de la Universidad de Creta en 2002, un Doctorado honorario en Ciencias de la Universidad de Edimburgo en 2003, la Medalla de la Sociedad de Genética de la Sociedad de Genética del Reino Unido en 2005 y el Premio Franklin de la Organización de Bioinformática en 2006. Ashburner fue elegido Miembro de la Royal Society (FRS) en 1990 , [11] su certificado de elección dice:

"Distinguido por sus investigaciones de amplio alcance sobre la citología, la genética y la evolución de Drosophila melanogaster. Fue el primero en hacer un mapa completo de las bocanadas en los cromosomas politénicos de las glándulas salivales y en definir la etapa en la que se expresaba cada una. Continuó demostrando los efectos de varios estímulos, especialmente el choque térmico y la ecdisona, sobre las bocanadas en loci específicos, y correlacionó bocanadas particulares con productos genéticos particulares. Combinando metodología genética, citológica y molecular, ha investigado en detalle regiones cromosómicas particulares, especialmente la que rodea al gen Adh (alcohol deshidrogenasa), revelando muchas características novedosas de estructura y función. También ha hecho importantes contribuciones a la comprensión de la evolución y la especiación dentro del grupo de especies de D. melanogaster. Ashburner tiene una posición única como erudito y autoridad en todo el área de investigación de Drosophila". [56]

Ashburner fue nombrado miembro de la Academia Europaea (MAE) en 1989. [57]

Vida personal

Ashburner se casó con Francesca Ryan y tuvo un hijo y dos hijas, Rebecca, Geoffrey e Isabel. [5] [6] Murió el 7 de julio de 2023, a la edad de 81 años. [5] [17] [58]

Referencias

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