stringtranslate.com

Michael Eisen

Michael Bruce Eisen (nacido el 13 de abril de 1967) es un biólogo computacional estadounidense y ex [2] editor en jefe de la revista eLife . [3] Es profesor de genética , genómica y desarrollo en la Universidad de California, Berkeley . [4] [5] [6] [7] [8] Es un destacado defensor de la publicación científica de acceso abierto y es cofundador de Public Library of Science (PLOS) . En 2018, Eisen anunció su candidatura al Senado de los Estados Unidos por California como independiente , aunque no logró calificar para la boleta. [9]

Vida temprana y educación

Nacido en Boston, Eisen y su hermano Jonathan se criaron en una familia de científicos. Su abuelo era cristalógrafo de rayos X , su padre, Howard Eisen, médico, y su madre, Laura [10] , bioquímica. Se mudaron a Bethesda, Maryland, cuando Eisen tenía cuatro o cinco años. Los hermanos pasaban los veranos en Long Island con sus abuelos. Eisen afirma que amaba las ranas y las salamandras: "Incluso más que mi fetiche con las ranas, tengo un fetiche con los pantanos. Realmente me gusta estar en los pantanos". También estaba muy interesado en las matemáticas y fue capitán del equipo de matemáticas de la escuela secundaria. Eisen se graduó en la escuela secundaria Walt Whitman en 1985. Con la intención de especializarse en matemáticas en la Universidad de Harvard, se dio cuenta de que allí [podría encontrarse] con otros estudiantes de matemáticas más brillantes. Fue un momento de El indomable Will Hunting y decidió que no quería especializarse en matemáticas: "No quieres ser Salieri para Mozart". Durante sus años en Harvard, Eisen trabajó en "descifrar las estructuras tridimensionales de las proteínas". Le mostraron un microarray de ADN que le enseñó una "nueva forma de hacer biología". [11]

Eisen completó su doctorado en biofísica en la Universidad de Harvard y una licenciatura (también de Harvard) en matemáticas. [12] Estuvo bajo la supervisión de Don Craig Wiley [13] mientras estudiaba las proteínas del virus de la influenza A. [14]

Hay cosas que son realmente muy difíciles, esos son los tipos de problemas en los que uno quiere trabajar. No es tan fácil distinguir entre problemas imposibles y un problema que es realmente muy difícil. Pero aprender a hacerlo es de vital importancia. - Cosas que aprendí trabajando con Pat Brown ( Patrick O. Brown ) - 2015 [13]

Después de obtener su doctorado, Eisen fue becario postdoctoral en la Universidad de Stanford en el laboratorio de David Botstein , donde desarrolló, en particular, un método para interpretar datos de expresión genética de microarrays. La publicación de investigación seminal que escribió Eisen sobre este proyecto ha sido citada más de 16.000 veces. [15]

El béisbol y la biología

Cuando Eisen vivía en Tennessee, trabajaba como locutor de los partidos de un equipo de béisbol de las ligas menores, [12] los Columbia Mules. Se declara fanático de los Red Sox . [11] Él y el biólogo computacional James Fraser grabaron un vídeo para iBiology sobre el papel que las estadísticas de béisbol influyeron en su investigación. Su argumento es que secuenciar el ADN es similar a anotar un partido de béisbol, y que muchos biólogos computacionales aprendieron a pensar en los cálculos científicos a partir de un interés obsesivo en las estadísticas de béisbol. El ejercicio de comparar las estadísticas de un jugador específico con una base de datos de otros jugadores similares permite a un aficionado al béisbol predecir el rendimiento futuro. Este mismo sistema funciona con proteínas y funciones de predicción. A medida que se desarrollen herramientas que desglosen y rastreen todas las estadísticas relativas a los jugadores de béisbol, también mejorará la tecnología con la genética. Tanto con el béisbol como con la genética, se están desarrollando herramientas que refinan los modelos. [16] En una conferencia en 2015, Eisen declaró que recibió una computadora de su abuelo para su duodécimo cumpleaños y pasó los siguientes cinco años aprendiendo a programar para poder realizar un seguimiento de las estadísticas de béisbol. [13]

Investigación

Su investigación académica se centra en la evolución de la regulación genética . [17] [18] [19] [20] A pesar de este enfoque, el trabajo de Eisen ha abarcado históricamente disciplinas muy diversas. Por ejemplo, sus 5 artículos más citados cubren una amplia gama de temas, incluidos métodos de agrupamiento jerárquico , [17] aplicaciones a cánceres de mama humanos (con David Botstein y Charles Perou), [6] y el descubrimiento de subtipos de tumores en linfoma difuso de células B grandes (con Ash Alizadeh y Louis Staudt ). [18] Su trabajo de investigación más reciente ha sido sobre moscas de la fruta y Drosophila [21] y cómo "se desarrollan desde un pequeño óvulo unicelular hasta un adulto maduro. Dice que contienen información sobre lo que va mal en las personas a medida que envejecen". [12] Recibe financiación del Instituto Médico Howard Hughes para su investigación. [21]

Carrera al Senado de Estados Unidos 2018

Eisen anunció a través de Twitter el 25 de enero su intención de postularse para el Senado de los Estados Unidos por California en 2018 para el puesto de la senadora demócrata Dianne Feinstein , registrando el nombre de usuario de Twitter SenatorPhD . [22] Su lema de campaña fue "Libertad, igualdad, realidad". Las razones de Eisen para postularse al Congreso incluyeron su percepción de que la administración Trump no respondía al cambio climático y otros problemas relacionados con la ciencia. Otra razón por la que Eisen decidió postularse fue su experiencia al ver a los designados para el gabinete siendo entrevistados por el Senado sobre el cambio climático. Él pensó: "Sería realmente bueno que los científicos hicieran las preguntas a los designados para el Gabinete, porque los senadores no parecen entender el tema y no están haciendo las preguntas correctas". [12] Él siente que si la ciencia va a estar a la vanguardia de la formulación de políticas, "los científicos necesitan postularse para un cargo". Sintió que las primarias en la jungla de California de 2018 le brindaron una mejor oportunidad de llegar a los dos finalistas para las elecciones generales, pero no llegó a los dos finalistas (que fueron Dianne Feinstein y Kevin de León ). [12]

Durante mucho tiempo, los científicos han observado cómo se erosionan los procesos políticos y cómo los políticos se burlan abiertamente de la ciencia y desestiman el papel que desempeña la ciencia en nuestra vida cotidiana. Los científicos han estado sentados aquí esperando que alguien venga a defender esos principios. En mi opinión, la política debería funcionar de manera similar a la ciencia. Deberíamos tratar de averiguar qué está pasando en el mundo y luego debatir la mejor manera de hacerlo para mejorar el mundo. Las mejores herramientas que tenemos para caracterizar la realidad son las herramientas de observación que la ciencia utiliza todo el tiempo. Gran parte de la política ha rechazado ese principio básico de que los científicos viven y respiran todo el tiempo. [12]

Eisen abandonó la carrera cuando no logró calificar para las elecciones primarias de junio de 2018. [23]

Vida electrónicaRedacción y despido

En 2019, Eisen fue nombrado segundo editor en jefe de la revista científica de acceso abierto eLife .

En 2020, en respuesta a una pregunta en Twitter , Eisen bromeó diciendo que el gusano redondo C. elegans era el animal más publicitado porque "se mueven hacia adelante, se mueven hacia atrás y, ocasionalmente, se follan a sí mismos. Eso es todo". A algunos investigadores no les hizo gracia la broma, y ​​la junta de eLife le pidió a Eisen que cuidara su lenguaje en Twitter. [24] [25] También en 2020, Eisen estuvo involucrado en la historia que rodeó la muerte por SARS-CoV-2 de una profesora anónima queer hopi con la que había interactuado en Twitter. La cuenta resultó ser un engaño creado y dirigido por la neurocientífica BethAnn McLaughlin , que fundó MeTooSTEM. Eisen fue una de las tres personas que asistieron a un homenaje por Zoom al individuo ficticio. [26]

En 2023, bajo su liderazgo, la revista se alejó del modelo tradicional de " revisar, luego publicar ", y en su lugar requirió que los autores enviaran preimpresiones y luego publicaran las revisiones de los editores de la revista junto con los manuscritos, lo que significa que la revista no aceptó ni rechazó las presentaciones. [27] Eisen dijo que la medida tenía la intención de reducir la prominencia del editor y, en cambio, centrar la atención en los autores y su trabajo. Esta medida provocó tanto elogios entusiastas de algunos, incluidos algunos editores de eLife , como una fuerte reacción de otros dentro de la organización, incluidos algunos editores y editores senior. Un artículo de noticias en la revista Nature describió la "lucha en eLife". Al menos uno de los cinco editores adjuntos renunció. En una carta privada a Eisen en enero de 2023, 30 editores amenazaron con renunciar una vez que los cambios se implementaran por completo. En marzo de 2023, 29 editores de eLife , incluido el editor en jefe fundador y ganador del Premio Nobel Randy Schekman , instaron a que Eisen fuera reemplazado de inmediato en una carta al editor ejecutivo de la editorial de la revista. Eisen desestimó esto en una entrevista como “científicos poderosos que no quieren cambiar un sistema que los ha beneficiado”. Eisen tuiteó el 12 de marzo de 2023 que los académicos estaban “presionando mucho para que me despidieran”, una publicación que posteriormente fue eliminada. [28] El 17 de marzo de 2023 tuiteó: “No tengo mucho que agregar a la historia de @nature sobre @eLife. Informó con precisión sobre los esfuerzos de Randy Schekman y unas pocas docenas de editores para descarrilar lo que estamos haciendo, les dio la oportunidad de explicar sus motivaciones y a nosotros una oportunidad justa de responder”. Más tarde describió su relación con la junta como “algo tensa” y que algunos “la tenían tomada conmigo”. [25]

El 13 de octubre de 2023, poco después de que Hamás atacara a Israel, Eisen tuiteó una historia del sitio web satírico The Onion con el titular: "Gazanos moribundos criticados por no usar sus últimas palabras para condenar a Hamás". Eisen dijo: "The Onion habla con más coraje, perspicacia y claridad moral que los líderes de todas las instituciones académicas juntas. Ojalá hubiera una universidad @TheOnion". [29] La publicación provocó algunas críticas, incluso de investigadores israelíes que pidieron a sus colegas que evitaran publicar en eLife mientras él fuera editor. El presidente de la junta directiva de eLife le pidió a Eisen que eliminara su publicación de Twitter, pero él se negó a hacerlo "porque eso sería capitular ante lo que pensé que era un esfuerzo realmente mal dirigido para silenciar cualquier expresión de apoyo a los palestinos". Algunos investigadores también expresaron su exasperación porque, en 2018, Eisen había tuiteado "A la mierda con Israel". Más tarde aclaró que se refería a las Fuerzas de Defensa de Israel que mataron a más de 60 personas que intentaban cruzar de Gaza a Israel durante la Gran Marcha del Retorno . [25] El 23 de octubre de 2023, eLife despidió a Eisen . En respuesta al despido, al menos cinco de los editores de eLife renunciaron y otros científicos dijeron que dejarían de participar en los eventos de eLife en solidaridad con Eisen. Se organizó una carta de petición para protestar contra el despido de Eisen. La petición, que fue firmada por más de 2.000 científicos, académicos e investigadores, decía que la acción de eLife está teniendo un "efecto paralizante" sobre la libertad de expresión en el mundo académico. [30]

eLife publicó un comunicado en el que decía: "Mike ha recibido una respuesta clara de la junta directiva de que su enfoque del liderazgo, la comunicación y las redes sociales ha sido en momentos clave perjudicial para la cohesión de la comunidad que estamos tratando de construir y, por lo tanto, para la misión de eLife . Es en este contexto que una mayor incidencia de este comportamiento ha contribuido a la decisión de la junta". [29] La respuesta de Eisen fue: "Se referían a esa maldita cosa del gusano. ¡No estoy bromeando!". [25] Un portavoz de eLife aclaró más tarde en un correo electrónico a The Hindu, diciendo: "Valoramos y respetamos el derecho de todos a la libertad de expresión, incluida la expresión política y el derecho legal a protestar. Particularmente para aquellos en puestos de liderazgo, ejercer ese derecho conlleva responsabilidades: una expectativa de mostrar buen juicio y un deber de cuidado hacia las comunidades a las que sirven. No creemos que se hayan demostrado esas cualidades". [31]

En el informe anual de 2023 de eLife , el presidente de la junta directiva dijo: “En octubre, nos separamos de nuestro editor en jefe, Michael Eisen, y queremos reconocer la extraordinaria visión y liderazgo que brindó a eLife, lo que nos permite aprovechar su legado a medida que hacemos crecer nuestro modelo editorial”. [32]

El 10 de noviembre de 2023, en respuesta a un tuit que decía “¿Cómo hacer que las reuniones de profesores sean más interesantes? Solo respuestas incorrectas”, Eisen tuiteó “Siéntenme al lado de Randy Schekman”, haciendo referencia al anterior editor en jefe.

Defensa del acceso abierto

A lo largo de su carrera ha sido un defensor de la " ciencia abierta ", que es la publicación gratuita del producto material e intelectual de la investigación científica. Es un destacado defensor de la publicación científica de acceso abierto [33] [34] [35] y es cofundador de Public Library of Science (PLOS) y forma parte de la junta directiva de PLOS, del Comité de Dirección y Defensa Académica de Open Library of Humanities [36] y es asesor de Science Commons .

En 2012, Eisen comenzó a protestar contra la Ley de Trabajos de Investigación como parte de su llamado a promover el acceso abierto a la información. [37]

Premios y honores

En 2002, Eisen recibió el premio inaugural Benjamin Franklin en bioinformática por su trabajo en PLOS y la disponibilidad de acceso abierto de su software de análisis de grupos de microarrays. [38]

Referencias

  1. ^ Publicaciones de Michael Eisen indexadas por Google Scholar
  2. ^ Science News Staff (24 de octubre de 2023). «Despidieron a un destacado editor de una revista por respaldar un artículo satírico sobre el conflicto entre Israel y Hamás». Science . Archivado desde el original el 24 de octubre de 2023 . Consultado el 24 de octubre de 2023 .
  3. ^ "eLife da la bienvenida a Michael Eisen como editor jefe". eLife . 2019-03-05 . Consultado el 2019-03-05 .
  4. ^ "Michael B. Eisen, PhD". Instituto Médico Howard Hughes . Consultado el 23 de septiembre de 2013 .
  5. ^ Publicaciones de Michael Eisen indexadas en la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
  6. ^ ab Perou, CM; Sorlie, T; Eisen, MB; Van De Rijn, M; Jeffrey, SS; Rees, California; Pollack, JR; Ross, DT; Johnsen, H; Akslen, Luisiana; Fluge, O; Pergamenschikov, A; Williams, C; Zhu, SX; Lønning, PE; Børresen-Dale, AL; Marrón, PO; Botstein, D (2000). "Retratos moleculares de tumores de mama humanos". Naturaleza . 406 (6797): 747–52. Código Bib :2000Natur.406..747P. doi :10.1038/35021093. PMID  10963602. S2CID  1280204.
  7. ^ Iyer, VR (1999). "El programa transcripcional en la respuesta de los fibroblastos humanos al suero". Science . 283 (5398): 83–7. Bibcode :1999Sci...283...83I. doi :10.1126/science.283.5398.83. PMID  9872747.
  8. ^ Ross, DT; Scherf, U; Eisen, MB; Perou, CM; Rees, C; Spellman, P; Iyer, V; Jeffrey, SS; Van De Rijn, M; Waltham, M; Pergamenschikov, A; Lee, JC; Lashkari, D; Shalon, D; Myers, TG; Weinstein, JN; Botstein, D; Brown, PO (2000). "Variación sistemática en los patrones de expresión génica en líneas celulares de cáncer humano". Nature Genetics . 24 (3): 227–35. doi :10.1038/73432. PMID  10700174. S2CID  1135137.
  9. ^ Cohen, Jon (27 de enero de 2017). «Preguntas y respuestas: Michael Eisen aspira a ser el primer biólogo de moscas en el Senado de Estados Unidos». Ciencia | AAAS . Consultado el 13 de abril de 2020 .
  10. ^ Okie, Susan. "CIENTÍFICO DEL NIH SE SUICIDÓ EN MEDIO DE UNA INVESTIGACIÓN SOBRE UN ARTÍCULO". Washington Post . Consultado el 7 de febrero de 2017 .
  11. ^ ab Mechanic, Michael. "¡Roba este trabajo de investigación! (Ya lo pagaste)". Mother Jones . Consultado el 7 de febrero de 2017 .
  12. ^ abcdef Krieger, Lisa (4 de febrero de 2017). "El biólogo molecular del Área de la Bahía Michael Eisen anuncia su candidatura al Senado de Estados Unidos". San Jose Mercury News . Consultado el 7 de febrero de 2017 .
  13. ^ abc «Michael Eisen: béisbol, matemáticas y biología». India Bio Science. Archivado desde el original el 21 de diciembre de 2021. Consultado el 7 de febrero de 2017 .
  14. ^ Eisen, Michael Bruce (1996). Estudios estructurales de las proteínas del virus de la influenza A (tesis doctoral). Universidad de Harvard. OCLC  48938206.
  15. ^ Eisen, MB; Spellman, PT; Brown, PO; Botstein, D (8 de diciembre de 1998). "Análisis de grupos y visualización de patrones de expresión de todo el genoma". Proc Natl Acad Sci USA . 95 (25): 14863–8. Bibcode :1998PNAS...9514863E. doi : 10.1073/pnas.95.25.14863 . PMC 24541 . PMID  9843981. 
  16. ^ "James Fraser y Michael Eisen: el béisbol se encuentra con la biología". Educación . iBiology . Consultado el 7 de febrero de 2017 .
  17. ^ ab Eisen, M.; Spellman, P.; Brown, P.; Botstein , D. (1998). "Análisis de conglomerados y visualización de patrones de expresión de todo el genoma". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 95 (25): 14863–14868. Bibcode :1998PNAS...9514863E. doi : 10.1073/pnas.95.25.14863 . PMC 24541 . PMID  9843981. 
  18. ^ ab Alizadeh, AA; Eisen, MB; Davis, RE; Ma, C.; Lossos, IS; Rosenwald, A.; Boldrick, JC; Sabet, H.; Tran, T.; Yu, X.; Powell, JI; Yang, L.; Marti, GE; Moore, T.; Hudson Jr, J.; Lu, L.; Lewis, DB; Tibshirani, R.; Sherlock, G.; Chan, WC; Greiner, TC; Weisenburger, DD; Armitage, JO; Warnke, R.; Levy, R.; Wilson, W.; Grever, MR; Byrd, JC; Botstein, D.; Brown, PO (2000). "Distintos tipos de linfoma difuso de células B grandes identificados mediante perfiles de expresión génica". Nature . 403 (6769): 503–511. Código Bibliográfico : 2000Natur.403..503A. doi :10.1038/35000501. PMID  10676951. S2CID  4382833.
  19. ^ Clark, AG; et al. (2007). "Evolución de genes y genomas en la filogenia de Drosophila". Nature . 450 (7167): 203–18. Bibcode :2007Natur.450..203C. doi : 10.1038/nature06341 . PMID  17994087.
  20. ^ Spellman, PT; Sherlock, G.; Zhang, MQ; Iyer, VR; Anders, K.; Eisen, MB; Brown, PO; Botstein, D.; Futcher, B. (1998). "Identificación completa de genes regulados por el ciclo celular de la levadura Saccharomyces cerevisiae mediante hibridación de microarrays". Biología molecular de la célula . 9 (12): 3273–97. doi :10.1091/mbc.9.12.3273. PMC 25624 . PMID  9843569. 
  21. ^ ab Harmon, Amy; Henry Fountain (6 de febrero de 2017). "En la era de Trump, los científicos muestran signos de pulso político". The New York Times . Consultado el 7 de febrero de 2017 .
  22. ^ Reardon, Sara (2017). "Genetista lanza candidatura para el Senado de Estados Unidos". Nature . doi : 10.1038/nature.2017.21381 . S2CID  78431422 . Consultado el 7 de febrero de 2017 .
  23. ^ "Michael Eisen". Ballotpedia . Consultado el 13 de abril de 2020 .
  24. ^ Jones, Asher; Elbein, Tyler O. (2 de agosto de 2020). "La broma sobre gusanos provoca una guerra de comentarios científicos en Twitter por acusaciones de sexismo y racismo". The Daily Beast . Consultado el 22 de agosto de 2024 .
  25. ^ abcd Mechanic, Michael (17 de noviembre de 2023). "Una importante revista científica despidió a su editor por un tuit a favor de Palestina. No se arrepiente". Mother Jones . Consultado el 31 de agosto de 2024 .
  26. ^ Bromwich, Jonah E.; Marcus, Ezra (4 de agosto de 2020). "El profesor anónimo que no lo fue". The New York Times . Consultado el 22 de agosto de 2024 .
  27. ^ Brainard, Jeffrey (20 de octubre de 2022). «La revista busca cambiar radicalmente la publicación científica al revisar únicamente los manuscritos, en lugar de aceptarlos». Science News . Consultado el 24 de octubre de 2023 .
  28. ^ Abbott, Alison (17 de marzo de 2023). "Conflictos en eLife: dentro de la búsqueda de una revista para cambiar radicalmente la publicación científica". Nature . Consultado el 27 de agosto de 2024 .
  29. ^ ab "Despidieron a un destacado editor de una revista por respaldar un artículo satírico sobre el conflicto entre Israel y Hamás". Science . 23 de octubre de 2023 . Consultado el 22 de agosto de 2024 .
  30. ^ "El despido del editor de una revista científica tras un artículo sobre Gaza provoca una división por la libertad de expresión". NBC News . 2023-10-26 . Consultado el 2023-11-01 .
  31. ^ Prasad, R (28 de octubre de 2023). «'eLife lamenta las trágicas pérdidas de vidas civiles, tanto israelíes como palestinas'». The Hindu . Consultado el 18 de septiembre de 2024 .
  32. ^ Hackett, Joanne (5 de septiembre de 2024). «Informe anual: revisión de 2023». eLife . Consultado el 18 de septiembre de 2024 .
  33. ^ Eisen, Michael (8 de octubre de 2003). "Publica y serás alabado". The Guardian . Consultado el 23 de septiembre de 2013 .
  34. ^ Brown, PO ; Eisen, MB; Varmus, HE (2003). "Por qué PLoS se convirtió en editor". PLOS Biology . 1 (1): E36. doi : 10.1371/journal.pbio.0000036 . PMC 212706 . PMID  14551926. 
  35. ^ Personal de WIRED. «Premios Wired Rave 2004». Wired . ISSN  1059-1028 . Consultado el 11 de agosto de 2023 .
  36. ^ Howard, Jennifer (29 de enero de 2013). "Proyecto pretende llevar la apertura al estilo PLoS a las humanidades". The Chronicle of Higher Education . Consultado el 19 de noviembre de 2013 .
  37. ^ Dobbs, David (6 de enero de 2012). "El Congreso considera poner un muro de pago a la ciencia por la que ya pagaste". wired.com . Consultado el 12 de febrero de 2012 .
  38. ^ "Premio Benjamin Franklin - Bioinformatics.org". www.bioinformatics.org . Consultado el 7 de febrero de 2017 .

Enlaces externos