stringtranslate.com

Lincoln Stein

Lincoln David Stein es científico y profesor de bioinformática y biología computacional en el Instituto de Investigación del Cáncer de Ontario . [2] [4] [5]

Educación

Stein completó un Doctorado en Medicina en la Facultad de Medicina de Harvard y un Doctorado en Biología Celular en la Universidad de Harvard, ambos en 1989 [6] a través del programa MD-PhD . Su tesis investigó la clonación de genes en Schistosoma mansoni . [6]

Carrera

De 1992 a 1997 fue director de informática en el Centro del Genoma del Instituto de Tecnología de Massachusetts (MIT) , Instituto Whitehead de Investigación Biomédica. De 1998 a 2004 fue profesor asociado en el Laboratorio Cold Spring Harbor . Ha estado trabajando en el Instituto de Investigación del Cáncer de Ontario desde 2007. [ cita necesaria ]

Investigación

Los proyectos de investigación actuales de Stein [2] [5] incluyen Reactome , [7] WormBase , [7] BioPerl , [8] Gramene, [9] ENCODE , [10] [11] [12] Generic Model Organism Database , [13 ] la Ontología de Secuencia [14] y la Computación en la Nube . [15]

Stein también es el desarrollador original de CGI.pm y colaborador de mod_perl , ambos ampliamente utilizados en el lenguaje de programación Perl para aplicaciones web, así como de muchos otros módulos de Perl y libros asociados. [16] [17] [18] [19] [20]

Premios y honores

Stein recibió el premio Benjamin Franklin (Bioinformática) en 2004. [21] Fue elegido miembro del ISCB en 2016 por la Sociedad Internacional de Biología Computacional . [1]

Referencias

  1. ^ ab Anón (2017). "Becarios ISCB". iscb.org . Sociedad Internacional de Biología Computacional . Archivado desde el original el 2017-03-20.
  2. ^ Publicaciones de abc Lincoln Stein indexadas por Google Scholar
  3. ^ "116663444".
  4. ^ "El Instituto de Ontario para la Investigación del Cáncer". Archivado desde el original el 22 de abril de 2011.
  5. ^ ab Publicaciones de Lincoln Stein indexadas por la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
  6. ^ ab Stein, Lincoln David (1989). Clonación de genes regulados por el desarrollo de Schistosoma mansoni. harvard.edu (tesis doctoral). Universidad Harvard. OCLC  23368773.
  7. ^ ab Croft, D.; O'Kelly, G.; Wu, G.; Haw, R.; Gillespie, M.; Matthews, L.; Caudy, M.; Garapati, P.; Gopinath, G.; Jasal, B.; Júpiter, S.; Kalatskaya, I.; Mahajan, S.; Mayo, B.; Ndegwa, N.; Schmidt, E.; Shamovsky, V.; Yung, C.; Birney, E.; Hermjakob, H.; d'Eustachio, P.; Stein, L. (2010). "Reactome: una base de datos de reacciones, vías y procesos biológicos". Investigación de ácidos nucleicos . 39 (Problema de la base de datos): D691–D697. doi :10.1093/nar/gkq1018. PMC 3013646 . PMID  21067998. 
  8. ^ Stajich, JE; Bloque, D.; Boulez, K.; Brenner, S .; Chervitz, S.; Dagdigian, C.; Fuellen, G.; Gilbert, J.; Korf, I.; Lapón, H.; Lehväslaiho, H.; Matsalla, C.; Mungall, CJ; Osborne, BI; Pocock, señor; Schattner, P.; Senger, M.; Stein, LD; Stupka, E.; Wilkinson, Doctor en Medicina; Birney, E. (2002). "El kit de herramientas de BioPerl: módulos Perl para las ciencias biológicas". Investigación del genoma . 12 (10): 1611-1618. doi :10.1101/gr.361602. PMC 187536 . PMID  12368254. 
  9. ^ Artículos, DH; Jaiswal, P.; Ni, J.; Sí, IV; Pan, X.; Clark, Kentucky; Teytelman, L.; Schmidt, Carolina del Sur; Zhao, W.; Chang, K.; Cartinhour, S.; Stein, LD; McCouch, SR (2002). "Gramene, una herramienta para la genómica de gramíneas". Fisiología de las plantas . 130 (4): 1606-1613. doi : 10.1104/págs.015248. PMC 1540266 . PMID  12481044. 
  10. ^ Gerstein MB , Lu ZJ, Van Nostrand EL, Cheng C, Arshinoff BI, Liu T, Yip KY, Robilotto R, Rechtsteiner A; et al. (2010). "Análisis integrativo del genoma de Caenorhabditis elegans mediante el proyecto modENCODE". Ciencia . 330 (6012): 1775–1787. Código Bib : 2010 Ciencia... 330.1775G. doi : 10.1126/ciencia.1196914. PMC 3142569 . PMID  21177976. {{cite journal}}: Mantenimiento CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  11. ^ Consorcio modENCODE, Roy S, Ernst J, Kharchenko PV, Kheradpour P, Negre N, Eaton ML, Landolin JM, Bristow CA, Ma L; et al. (2010). "Identificación de elementos funcionales y circuitos reguladores por Drosophila modENCODE". Ciencia . 330 (6012): 1787–1797. Código Bib : 2010 Ciencia... 330.1787R. doi : 10.1126/ciencia.1198374. PMC 3192495 . PMID  21177974. {{cite journal}}: Mantenimiento CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  12. ^ Contrino, S.; Smith, enfermera registrada; Butaño, D.; Carr, A.; Hu, F.; Lyne, R.; Rutherford, K.; Kalderimis, A.; Sullivan, J.; Carbono, S.; Kephart, ET; Lloyd, P.; Stinson, EO; Washington, Países Bajos; Perry, Doctor en Medicina; Ruzanov, P.; Zha, Z.; Lewis, SE; Stein, LD; Micklem, G. (2011). "ModMine: acceso flexible a los datos modENCODE". Investigación de ácidos nucleicos . 40 (Problema de la base de datos): D1082 – D1088. doi : 10.1093/nar/gkr921. PMC 3245176 . PMID  22080565. 
  13. ^ Stein, LD; Mungall, C.; Shu, S.; Caudy, M.; Mangone, M.; Día, A.; Nickerson, E.; Stajich, JE; Harris, TW; Arva, A.; Lewis, S. (2002). "El navegador de genoma genérico: un componente básico para una base de datos de sistema de organismo modelo". Investigación del genoma . 12 (10): 1599-1610. doi :10.1101/gr.403602. PMC 187535 . PMID  12368253. 
  14. ^ Eilbeck, K.; Lewis, SE ; Mungall, CJ; Yandell, M.; Stein, L.; Durbin, R .; Ashburner, M. (2005). "La ontología de secuencia: una herramienta para la unificación de anotaciones del genoma". Biología del genoma . 6 (5): R44. doi : 10.1186/gb-2005-6-5-r44 . PMC 1175956 . PMID  15892872. 
  15. ^ Stein, LD (2010). "El caso de la computación en la nube en la informática del genoma". Biología del genoma . 11 (5): 207. doi : 10.1186/gb-2010-11-5-207 . PMC 2898083 . PMID  20441614. 
  16. ^ Stein, Lincoln D. (1998). Guía oficial de programación con CGI. pm: [el estándar para crear scripts web]. Nueva York: Wiley. ISBN 978-0-471-24744-9.
  17. ^ Doug MacEachern; Stein, Lincoln D. (1999). Escribiendo módulos de Apache con Perl y C. Sebastopol, CA: O'Reilly. ISBN 978-1-56592-567-0.
  18. ^ Stein, Lincoln D. (2001). Programación de redes con Perl . Boston: Addison-Wesley. ISBN 978-0-201-61571-5.
  19. ^ Stein, Lincoln D. (1997). Cómo configurar y mantener un sitio web. Boston: Addison-Wesley. ISBN 978-0-201-63462-4.
  20. ^ Stein, Lincoln D. (1998). Seguridad web: una guía de referencia paso a paso . Boston: Addison-Wesley. ISBN 978-0-201-63489-1.
  21. ^ http://www.bioinformatics.org/franklin/2004/ Premio Benjamin Franklin 2004 otorgado a Lincoln D. Stein