En Río de Janeiro recibió una educación primaria y secundaria bilingüe en la Escuela Corcovado.
Obtuvo su licenciatura en Geología por la UFRJ en 1991, y se doctoró en 1996 por la Universidad de Columbia (Nueva York) en un programa conjunto con el Museo Americano de Historia Natural.
Kellner ha organizado o participado en varias expediciones paleontológicas a muchos lugares del mundo, incluyendo Brasil (Mato Grosso, Río Grande do Sul y Ceará), los desiertos de Atacama (Chile) y Kermán (Irán), los famosos depósitos de Liaoning (China) e incluso a la Antártida (la isla James Ross).
Sobre este particular, él es fundador de una distintiva escuela brasileña para el estudio de los pterosaurios, con su propio modelo filogenético favorito, terminología cladística y nomenclatura.
Otros modelos y opciones de nomenclatura que rivalizan con éste han sido proporcionados por el influyente investigador británico sobre pterosaurios, David Unwin.