stringtranslate.com

James J. Collins

James Joseph Collins (nacido el 26 de junio de 1965) es un ingeniero biomédico y bioingeniero estadounidense que se desempeña como profesor Termeer de Ingeniería Médica y Ciencia en el Instituto Tecnológico de Massachusetts (MIT), donde también es director de la Clínica Abdul Latif Jameel del MIT para Aprendizaje Automático en Salud .

Collins realizó una investigación que demostró que los enfoques de inteligencia artificial (IA) se pueden utilizar para descubrir nuevos antibióticos, como la halicina y la abaucina . [1] Se desempeña como director del Proyecto Antibióticos-IA en el MIT, que cuenta con el apoyo de The Audacious Project , y es miembro del Programa Harvard-MIT en Ciencias de la Salud y Tecnología . También es miembro principal del cuerpo docente del Instituto Wyss de Ingeniería Inspirada en la Biología de la Universidad de Harvard y miembro del Instituto Broad . [2]

Collins es uno de los fundadores del campo de la biología sintética , y su trabajo sobre circuitos genéticos sintéticos y células programables ha llevado al desarrollo de nuevas clases de diagnósticos y terapias, que han influido en la investigación en la detección y el tratamiento de infecciones causadas por patógenos emergentes como el ébola, el zika, el SARS-CoV-2 y las bacterias resistentes a los antibióticos. También es investigador en biología de sistemas , habiendo realizado descubrimientos sobre las acciones de los antibióticos y la aparición de la resistencia a los antibióticos . [3]

Collins es miembro de la Academia Nacional de Ingeniería , la Academia Nacional de Medicina y la Academia Nacional de Ciencias por sus contribuciones a la biología sintética y las redes genéticas diseñadas. En 2023, recibió una mención de Clarivate por la investigación con más probabilidades de recibir un premio Nobel .

Vida temprana y educación

Collins nació el 26 de junio de 1965 en El Bronx , luego se mudó a Bellerose, Nueva York . [4] Su padre era un ingeniero de aviación que trabajó en proyectos para la NASA y el ejército. [5] A los 10 años, Collins se mudó a New Hampshire con su familia después de terminar la escuela primaria, [6] creciendo en Nashua . [7] Desarrolló por primera vez un interés en la ingeniería médica cuando uno de sus abuelos se quedó ciego y el otro sufrió múltiples accidentes cerebrovasculares . [5]

Collins originalmente tenía la intención de estudiar ingeniería eléctrica como estudiante de grado y fue aceptado en el Instituto Tecnológico de Massachusetts (MIT) y el Instituto Politécnico Rensselaer (RPI), pero decidió en cambio asistir al College of the Holy Cross , ya que encontró el ambiente en la universidad más amigable. Collins recordó más tarde: "Me enamoré del lugar. Quería trabajar duro y obtener una educación sólida, pero también quería disfrutar. Quería obtener una amplia experiencia y sentí que podía obtenerla en Holy Cross". [3]

En Holy Cross, Collins fue oficial de clase y miembro de los equipos de atletismo y cross country , donde corrió la milla en 4:17. [8] También escribió para el periódico de la escuela y enseñó como parte de la Confraternidad de Doctrina Cristiana (CCD). Como estudiante de pregrado, había sido galardonado con un Premio al Servicio Voluntario del Presidente y fue designado como Becario Fenwick en 1986, uno de los más altos honores de la universidad. [9] Collins se graduó de Holy Cross en 1987 como el mejor alumno de la clase , recibiendo una Licenciatura en Artes (BA) en física, summa cum laude . [3] Su tesis de pregrado se tituló "Estimulación neuromuscular funcional: un análisis de los fundamentos biomecánicos y neuromusculares de la marcha". [10]

Después de graduarse en Holy Cross, Collins fue uno de los cuatro estudiantes de Nueva Inglaterra seleccionados para una beca Rhodes , que utilizó para estudiar ingeniería médica en Inglaterra en la Universidad de Oxford . [11] En Oxford, fue miembro del Balliol College y obtuvo un Doctorado en Filosofía (DPhil) en 1990, especializándose en ingeniería médica y mecánica. [12] Su disertación se tituló "Mecánica de las articulaciones: modelado de las extremidades inferiores" y fue supervisada por John J. O'Connor. [13]

Carrera

Collins regresó a los Estados Unidos para unirse a la facultad de la Universidad de Boston . Allí, estableció un laboratorio y se convirtió en profesor distinguido William F. Warren de la universidad, profesor universitario , profesor de ingeniería biomédica, profesor de medicina y codirector del Centro de Biodinámica y director del Centro de Biología Sintética. En 2008, Collins fue nombrado investigador del Instituto Médico Howard Hughes , convirtiéndose en el primer investigador de la Universidad de Boston. [7]

En 2014, Collins pasó a ser profesor en el Instituto Tecnológico de Massachusetts. [14] Actualmente, Collins es profesor Termeer de Ingeniería y Ciencia Médica y profesor de Ingeniería Biológica en el MIT . Collins también es miembro fundador del Instituto Wyss de Ingeniería Inspirada en la Biología en la Universidad de Harvard y miembro del Instituto Broad . Collins también es profesor principal de ciencias biológicas en la Clínica Jameel del MIT desde 2018. [15] [16]

Collins ha estado involucrado en varias empresas emergentes y sus inventos y tecnologías han sido licenciados por más de 25 empresas de biotecnología y dispositivos médicos. Collins es el cofundador científico de varias empresas de biotecnología y organizaciones sin fines de lucro.

En 2010, Collins fue designado por el presidente Barack Obama como miembro de la Comisión Presidencial para el Estudio de Cuestiones Bioéticas . [17]

Trabajar

Biología sintética

El trabajo de Collins sobre circuitos genéticos sintéticos lanzó el campo de la biología sintética . [18] Fue el primero (junto con Michael Elowitz y Stanislas Leibler ) en demostrar que se pueden aprovechar las propiedades biofísicas de los ácidos nucleicos y las proteínas para crear circuitos biológicos, que se pueden usar para recablear y reprogramar células vivas.

En un artículo publicado en Nature , [19] Collins diseñó y construyó un interruptor genético (una red reguladora de genes biestable y sintética) en E. coli. El interruptor forma una unidad de memoria celular direccionable y sintética con amplias implicaciones para la biofísica, la biomedicina y la biotecnología. En el mismo número de Nature, Elowitz y Leibler demostraron que se puede construir un oscilador genético sintético (llamado represor) en E. coli. [20] El artículo de Collins en Nature sobre el interruptor genético [19] y el artículo de Elowitz y Leibler en Nature [20] sobre el represor se consideran piezas fundamentales, que marcan el comienzo de la biología sintética. [18]

Basándose en este trabajo, Collins demostró que las redes de genes sintéticos se pueden utilizar como módulos reguladores e interconectarse con los circuitos genéticos de un microbio para crear células programables para una variedad de aplicaciones, [21] por ejemplo, probióticos sintéticos para servir como diagnósticos vivos y terapias vivas para detectar, tratar y prevenir infecciones como el cólera y C. difficile. [22] [23] También diseñó y construyó riboreguladores diseñados (interruptores de ARN) para detección y control, [24] [25] [26 ] [ 27] [28] [29] interruptores de eliminación microbiana y contadores genéticos para biocontención, [30] [31] [32] bacteriófagos sintéticos para combatir infecciones bacterianas resistentes, [33] [34] conmutadores genéticos para ingeniería metabólica, [35] e interruptores genéticos ajustables para terapia génica y celular. [36] [37] [38] Recientemente, Collins desarrolló circuitos genéticos sintéticos libres de células y liofilizados, una plataforma innovadora que constituye la base para pruebas de diagnóstico económicas basadas en papel para patógenos emergentes (por ejemplo, Zika, Ébola, SARS-CoV-2, bacterias resistentes a los antibióticos), [39] [40] [41] [42] biosensores portátiles, [43] y fabricación biomolecular portátil (por ejemplo, para producir antígenos de vacunas) en el mundo en desarrollo. [44]

En el contexto de la biología sintética y la medicina regenerativa, Collins colaboró ​​con Derrick Rossi y George Q. Daley en un estudio que utilizaba tecnología de ARNm sintético para aplicaciones biomédicas. El equipo demostró que el ARNm sintético podía utilizarse para una reprogramación y rediferenciación de células madre altamente eficiente. Este trabajo se publicó en Cell Stem Cell en 2010, [45] y Rossi utilizó esta plataforma de tecnología de biología sintética para fundar Moderna . [46]

Collins también ha utilizado enfoques de biología sintética (computacionales y experimentales) para identificar y abordar cuestiones de física biológica significativas relacionadas con la regulación de la expresión génica y la dinámica celular. Collins, por ejemplo, ha utilizado redes de genes sintéticos para estudiar los efectos de la retroalimentación positiva en módulos genéticos, [47] [48] el papel y el origen de las fluctuaciones estocásticas en la expresión génica eucariota, [49] y las consecuencias fenotípicas del ruido de expresión génica y sus efectos en el destino celular y las estrategias de supervivencia microbiana en entornos estresantes. [50] Es importante destacar que Collins también ha demostrado cómo se pueden utilizar los circuitos de genes sintéticos para probar, validar y mejorar los modelos cualitativos y cuantitativos de regulación génica, [51] y ha demostrado que la teoría biofísica y la experimentación se pueden combinar en enfoques de abajo hacia arriba para obtener conocimientos biológicos sobre los intrincados procesos de regulación génica. [52]

Antibióticos y resistencia a los antibióticos

Collins es también uno de los principales investigadores en biología de sistemas mediante el uso de técnicas biofísicas experimentales-computacionales para realizar ingeniería inversa y analizar redes reguladoras de genes endógenos. [53] Collins y sus colaboradores demostraron que las redes de genes diseñadas a la inversa se pueden utilizar para identificar objetivos farmacológicos, mediadores biológicos y biomarcadores de enfermedades. [54]

Collins y sus colaboradores descubrieron, utilizando métodos de biología de sistemas, que todas las clases de antibióticos bactericidas inducen una vía común de muerte celular por daño oxidativo. [55] Este hallazgo indica que dirigirse a los sistemas bacterianos que remedian el daño oxidativo, incluida la respuesta SOS al daño del ADN, es un medio viable para mejorar la eficacia de todas las clases principales de antibióticos y limitar la aparición de resistencia a los antibióticos. Este trabajo estableció una relación mecanicista entre el metabolismo bacteriano y la eficacia de los antibióticos, que fue desarrollada y validada posteriormente por Collins y su equipo en una serie de estudios de seguimiento. [56]

Collins demostró que ciertos metabolitos podrían utilizarse para permitir que los antibióticos bactericidas erradiquen infecciones persistentes y tolerantes. [57] Además, Collins y sus colaboradores descubrieron que los niveles subletales de antibióticos activan la mutagénesis al estimular la producción de especies reactivas de oxígeno, lo que conduce a la resistencia a múltiples fármacos. [58] Collins y sus colegas, utilizando sus enfoques de sistemas, también descubrieron un mecanismo de resistencia basado en la población que constituye una forma de selección de parentesco por el cual un pequeño número de mutantes bacterianos resistentes, frente al estrés antibiótico, pueden, a cierto costo para ellos mismos, brindar protección a otras células más vulnerables, mejorando la capacidad de supervivencia de la población general en entornos estresantes. [59]

En 2020, Collins formó parte del equipo (junto con su colega y profesora principal de la Clínica Jameel del MIT, la profesora Regina Barzilay ) que anunció el descubrimiento a través del aprendizaje profundo de la halicina , el primer compuesto antibiótico nuevo en 30 años, que mata más de 35 bacterias potentes , incluidas la tuberculosis resistente a los antimicrobianos , la superbacteria C. difficile y dos de las tres bacterias más mortales de la Organización Mundial de la Salud . [60] En 2020, Collins, Barzilay y la Clínica Jameel del MIT también recibieron financiación a través de The Audacious Project para crear el Proyecto Antibióticos-IA y ampliar el descubrimiento de la halicina en el uso de la IA para responder a la crisis de resistencia a los antibióticos mediante el desarrollo de nuevas clases de antibióticos. [61]

Dinámica no lineal en sistemas biológicos

Collins también fue pionero en el desarrollo y uso de enfoques dinámicos no lineales para estudiar, imitar y mejorar la función biológica, [62] ampliando nuestra capacidad de comprender y aprovechar la física de los sistemas vivos. Collins, por ejemplo, propuso que el ruido de entrada podría usarse para mejorar la función sensorial y el control motor en humanos. [63] [64] Él y sus colaboradores demostraron que la sensación táctil y el control del equilibrio en adultos jóvenes y mayores, pacientes con accidente cerebrovascular y pacientes con neuropatía diabética podrían mejorarse con la aplicación de ruido mecánico subsensorial, [65] por ejemplo, a través de plantillas vibratorias. [66] Este trabajo ha llevado a la creación de una nueva clase de dispositivos médicos para abordar las complicaciones resultantes de la neuropatía diabética, restaurar la función cerebral después de un accidente cerebrovascular y mejorar el equilibrio de los ancianos.

Premios

Los logros científicos de Collins han sido reconocidos con numerosos premios, entre ellos el Premio Dickson en Medicina , el Premio Sanofi-Institut Pasteur, el Premio HFSP Nakasone , el Premio Max Delbruck , el Premio Gabbay , el Premio Pionero del Director del NIH, el Premio Académico Senior en Envejecimiento de la Fundación Médica Ellison, el Premio inaugural al Logro Excepcional Anthony J. Drexel, el Premio Lagrange de la Fundación CRT en Italia, el Premio BMES Robert A. Pritzker, el Premio de Investigación Biotecnológica Promega y haber sido seleccionado para el TR100 inaugural de Technology Review, 100 jóvenes innovadores que darán forma al futuro de la tecnología [67] , y el Scientific American 50, los 50 líderes más destacados en ciencia y tecnología. [68]

Collins es miembro de la Sociedad Estadounidense de Física , el Instituto de Física y el Instituto Estadounidense de Ingeniería Médica y Biológica. En 2003, recibió un " Premio Genius " de la Fundación MacArthur , [69] convirtiéndose en el primer bioingeniero en recibir este honor. [70] La cita del premio de Collins señaló: "A lo largo de su investigación, Collins demuestra una proclividad a identificar principios abstractos que subyacen a fenómenos biológicos complejos y a usar estos conceptos para resolver problemas concretos y prácticos". También fue honrado como un All-Star médico por los Boston Red Sox, y lanzó el primer lanzamiento en un juego de los Red Sox en Fenway Park. En 2016, Collins fue nombrado Investigador Distinguido Allen por el Paul G. Allen Frontiers Group. [71] Collins es miembro electo de las tres academias nacionales de EE. UU.: la Academia Nacional de Ciencias , la Academia Nacional de Ingeniería y la Academia Nacional de Medicina . También es miembro electo de la Academia Estadounidense de Artes y Ciencias , así como miembro fundador de la Academia Nacional de Inventores .

Collins ha recibido premios de docencia en la Universidad de Boston, incluido el Premio al Profesor de Ingeniería Biomédica del Año, el Premio al Profesor del Año de la Facultad de Ingeniería y la Copa Metcalf y el Premio a la Excelencia en la Enseñanza, que es el máximo honor docente otorgado por la Universidad de Boston. [72]

En 2023, Collins fue nombrado Laureado con el premio Clarivate junto con Michael Elowitz y Stanislas Leibler "por su trabajo pionero en circuitos genéticos sintéticos, que lanzó el campo de la biología sintética". [73]

Vida personal

La esposa de Collins es Mary McNaughton Collins; se conocieron mientras eran estudiantes en Holy Cross y se casaron en 1990. Ella es profesora en la Facultad de Medicina de Harvard y médica en el Hospital General de Massachusetts . [3] Tienen dos hijos: Katie, becaria Marshall en la Universidad de Cambridge , y Danny, becario Knight-Hennessy en la Universidad de Stanford . [74] [75]

Referencias

  1. ^ Trafton, Anne (20 de diciembre de 2023). «Usando IA, los investigadores del MIT identifican una nueva clase de candidatos a antibióticos». MIT News . Instituto Tecnológico de Massachusetts . Consultado el 6 de mayo de 2024 .
  2. ^ Saunders, Fenella (6 de febrero de 2023). "Sintetizando la ingeniería y la biología". Científico estadounidense . Sigma Xi . Consultado el 19 de diciembre de 2023 .
  3. ^ abcd Reardon, Michael (invierno de 2007). "El perfil: James J. Collins Jr. '87". Holy Cross Magazine . Vol. 41, no. 1. College of the Holy Cross . p. 80. Archivado desde el original el 22 de agosto de 2016. Consultado el 15 de abril de 2007 .
  4. ^ Khan, Firdos Alam (8 de mayo de 2014). Biotecnología en las ciencias médicas. CRC Press. ISBN 978-1-4822-2367-5.
  5. ^ ab Trafton, Anne (14 de noviembre de 2015). «Reprogramación de la biología: el ingeniero biológico James Collins diseña circuitos genéticos con funciones novedosas». MIT News . Instituto Tecnológico de Massachusetts . Consultado el 19 de diciembre de 2023 .
  6. ^ "James Collins, Ph.D. | Clase 2000 del Colegio de Becarios de AIMBE". Instituto Americano de Ingeniería Médica y Biológica . Consultado el 19 de diciembre de 2023 a través de Xconomy .
  7. ^ ab Baker, Billy (24 de noviembre de 2008). "El trabajo de sus sueños le otorga libertad para explorar". The Boston Globe . p. 16 . Consultado el 20 de diciembre de 2023 .
  8. ^ Zaman, Muhammed (20 de abril de 2020). Biografía de Resistance . Harper. ISBN 978-0062862976.
  9. ^ Brady 2012, pág. 184.
  10. ^ "Exbecarios, proyectos y asesores de Fenwick". College of the Holy Cross . Consultado el 19 de diciembre de 2023 .
  11. ^ Hopkin, Karen (1 de mayo de 2008). "Switched on Science". Revista The Scientist . Consultado el 17 de agosto de 2024 .
  12. ^ "Premio Dickson en Medicina otorgado a un exalumno de Balliol". Balliol College, Oxford . Universidad de Oxford . 28 de octubre de 2020 . Consultado el 4 de septiembre de 2023 .
  13. ^ "Disertaciones/Tesis: Mecánica articular: modelado de la extremidad inferior". Oxford Libraries Information System . Universidad de Oxford . Consultado el 19 de diciembre de 2023 .
  14. ^ "Collins honrado por Sigma Xi; Marnett renuncia como decano". www.asbmb.org . Consultado el 20 de diciembre de 2023 .
  15. ^ "Regina Barzilay, James Collins y Phil Sharp se suman al liderazgo de un nuevo esfuerzo sobre aprendizaje automático en el ámbito de la salud". MIT News . Instituto Tecnológico de Massachusetts . 3 de octubre de 2018 . Consultado el 13 de noviembre de 2020 .
  16. ^ "Personas". J-Clinic . Archivado desde el original el 30 de noviembre de 2021 . Consultado el 13 de noviembre de 2020 .
  17. ^ "Jim J. Collins, Ph.D. | Catalio Capital Management". www.cataliocapital.com . Consultado el 19 de diciembre de 2023 .[ enlace muerto permanente ]
  18. ^ ab Editorial: Diez años de sinergia, Nature 463, 269-270 (21 de enero de 2010), doi:10.1038/463269b
  19. ^ ab Gardner, TS; Cantor CR; Collins JJ (20 de enero de 2000). "Construcción de un interruptor genético en Escherichia coli". Nature . 403 (6767): 339–342. Bibcode :2000Natur.403..339G. doi :10.1038/35002131. PMID  10659857. S2CID  345059.
  20. ^ ab Elowitz MB, Leibler S (2000). "Una red oscilatoria sintética de reguladores transcripcionales". Nature . 403 (6767): 335–8. Bibcode :2000Natur.403..335E. doi :10.1038/35002125. PMID  10659856. S2CID  41632754.
  21. ^ Kobayashi H, Kaern M, Araki M, Chung K, Gardner TS, Cantor CR; et al. (2004). "Células programables: interconexión de redes de genes naturales y artificiales". Proc Natl Acad Sci USA . 101 (22): 8414–9. Bibcode :2004PNAS..101.8414K. doi : 10.1073/pnas.0402940101 . PMC 420408 . PMID  15159530. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  22. ^ Mao N, Cubillos-Ruiz A, Cameron DE, Collins JJ (2018). "Las cepas probióticas detectan y suprimen el cólera en ratones". Sci Transl Med . 10 (445). doi :10.1126/scitranslmed.aao2586. PMC 7821980 . PMID  29899022. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  23. ^ Cubillos-Ruiz A, Alcantar MA, Donghia NM, Cárdenas P, Avila-Pacheco J, Collins JJ (2022). "Un bioterapéutico vivo diseñado para la prevención de la disbiosis inducida por antibióticos". Nat Biomed Eng . 6 (7): 910–921. doi :10.1038/s41551-022-00871-9. PMID  35411114. S2CID  248100868.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  24. ^ Isaacs, FJ; Dwyer, DJ; Ding, C; Pervouchine, DD; Cantor, CR; Collins, JJ (2004). "Los riboreguladores diseñados permiten el control postranscripcional de la expresión génica". Nat Biotechnol . 22 (7): 823–4 2004. doi :10.1038/nbt986. PMID  15208640. S2CID  7289450.
  25. ^ Green AA, Silver PA, Collins JJ, Yin P (2014). "Interruptores de punto de apoyo: reguladores de expresión génica diseñados de novo". Cell . 159 (4): 925–39. doi :10.1016/j.cell.2014.10.002. PMC 4265554 . PMID  25417166. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  26. ^ Green AA, Kim J, Ma D, Silver PA, Collins JJ, Yin P (2017). "Computación lógica celular compleja utilizando dispositivos de ribocomputación". Nature . 548 (7665): 117–121. Bibcode :2017Natur.548..117G. doi :10.1038/nature23271. PMC 6078203 . PMID  28746304. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  27. ^ Angenent-Mari NM, Garruss AS, Soenksen LR, Church G, Collins JJ (2020). "Un enfoque de aprendizaje profundo para interruptores de ARN programables". Nat Commun . 11 (1): 5057. Bibcode :2020NatCo..11.5057A. doi :10.1038/s41467-020-18677-1. PMC 7541447 . PMID  33028812. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  28. ^ Zhao EM, Mao AS, de Puig H, Zhang K, Tippens ND, Tan X; et al. (2022). "Elementos sensibles al ARN para el control de la traducción en eucariotas". Nat Biotechnol . 40 (4): 539–545. doi : 10.1038/s41587-021-01068-2 . PMID  34711989. S2CID  240153815.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  29. ^ Gayet RV, Ilia K, Razavi S, Tippens ND, Lalwani MA, Zhang K; et al. (2023). "Edición de bases autocatalítica para el control de la traducción sensible al ARN". Nat Commun . 14 (1): 1339. Bibcode :2023NatCo..14.1339G. doi :10.1038/s41467-023-36851-z. PMC 10008589 . PMID  36906659. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  30. ^ Friedland AE, Lu TK, Wang X, Shi D, Church G, Collins JJ (2009). "Redes de genes sintéticos que cuentan". Science . 324 (5931): 1199–202. Bibcode :2009Sci...324.1199F. doi :10.1126/science.1172005. PMC 2690711 . PMID  19478183. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  31. ^ Callura JM, Dwyer DJ, Isaacs FJ, Cantor CR, Collins JJ (2010). "Seguimiento, ajuste y terminación de la fisiología microbiana mediante riboreguladores sintéticos". Proc Natl Acad Sci USA . 107 (36): 15898–903. Bibcode :2010PNAS..10715898C. doi : 10.1073/pnas.1009747107 . PMC 2936621 . PMID  20713708. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  32. ^ Chan CT, Lee JW, Cameron DE, Bashor CJ, Collins JJ (2016). "Interruptores de eliminación de microorganismos 'Deadman' y 'Passcode' para la contención bacteriana". Nat Chem Biol . 12 (2): 82–6. doi :10.1038/nchembio.1979. PMC 4718764 . PMID  26641934. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  33. ^ Lu TK, Collins JJ (2007). "Dispersión de biopelículas con bacteriófagos enzimáticos diseñados". Proc Natl Acad Sci USA . 104 (27): 11197–202. Bibcode :2007PNAS..10411197L. doi : 10.1073/pnas.0704624104 . PMC 1899193 . PMID  17592147. 
  34. ^ Lu TK, Collins JJ (2009). "Redes de genes dirigidas a bacteriófagos diseñados como adyuvantes para la terapia con antibióticos". Proc Natl Acad Sci USA . 106 (12): 4629–34. Bibcode :2009PNAS..106.4629L. doi : 10.1073/pnas.0800442106 . PMC 2649960 . PMID  19255432. 
  35. ^ Callura JM, Cantor CR, Collins JJ (2012). "Central genética para aplicaciones de biología sintética". Proc Natl Acad Sci USA . 109 (15): 5850–5. Bibcode :2012PNAS..109.5850C. doi : 10.1073/pnas.1203808109 . PMC 3326468 . PMID  22454498. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  36. ^ Deans TL, Cantor CR, Collins JJ (2007). "Un interruptor genético ajustable basado en ARNip y proteínas represoras para regular la expresión génica en células de mamíferos". Cell . 130 (2): 363–72. doi : 10.1016/j.cell.2007.05.045 . PMID  17662949. S2CID  7960766.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  37. ^ Cho JH, Collins JJ, Wong WW (2018). "Receptores de antígenos quiméricos universales para el control lógico y multiplexado de las respuestas de las células T". Cell . 173 (6): 1426–1438.e11. doi :10.1016/j.cell.2018.03.038. PMC 5984158 . PMID  29706540. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  38. ^ Cho JH, Okuma A, Sofjan K, Lee S, Collins JJ, Wong WW (2021). "Ingeniería de lógica avanzada y computación distribuida en células inmunes CAR humanas". Nat Commun . 12 (1): 792. Bibcode :2021NatCo..12..792C. doi :10.1038/s41467-021-21078-7. PMC 7862674 . PMID  33542232. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  39. ^ Pardee K, Green AA, Ferrante T, Cameron DE, DaleyKeyser A, Yin P; et al. (2014). "Redes de genes sintéticos basadas en papel". Cell . 159 (4): 940–54. doi :10.1016/j.cell.2014.10.004. PMC 4243060 . PMID  25417167. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  40. ^ Pardee K, Green AA, Takahashi MK, Braff D, Lambert G, Lee JW; et al. (2016). "Detección rápida y de bajo costo del virus del Zika utilizando componentes biomoleculares programables". Cell . 165 (5): 1255–1266. doi :10.1016/j.cell.2016.04.059. hdl : 1721.1/109241 . PMID  27160350. S2CID  3278532.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  41. ^ de Puig H, Lee RA, Najjar D, Tan X, Soeknsen LR, Angenent-Mari NM; et al. (2021). "SHERLOCK (miSHERLOCK) mínimamente instrumentado para el diagnóstico en el lugar de atención basado en CRISPR del SARS-CoV-2 y variantes emergentes". Ciencia avanzada . 7 (32). Código Bib : 2021SciA....7.2944D. doi :10.1126/sciadv.abh2944. PMC 8346217 . PMID  34362739. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  42. ^ Karlikow M, da Silva SJR, Guo Y, Cicek S, Krokovsky L, Homme P; et al. (2022). "Validación de campo de la realización de pruebas en papel para la detección de los virus Zika y chikungunya en muestras de suero". Ing. Nat Biomed . 6 (3): 246–256. doi :10.1038/s41551-022-00850-0. PMC 8940623 . PMID  35256758. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  43. ^ Nguyen PQ, Soenksen LR, Donghia NM, Angenent-Mari NM, de Puig H, Huang A; et al. (2021). "Materiales portátiles con sensores de biología sintética integrados para la detección de biomoléculas". Nat Biotecnología . 39 (11): 1366-1374. doi :10.1038/s41587-021-00950-3. hdl : 1721.1/131278 . PMID  34183860. S2CID  235673261.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  44. ^ Pardee K, Slomovic S, Nguyen PQ, Lee JW, Donghia N, Burrill D; et al. (2016). "Fabricación biomolecular portátil y a pedido". Cell . 167 (1): 248–259.e12. doi :10.1016/j.cell.2016.09.013. hdl : 1721.1/111574 . PMID  27662092. S2CID  8481521.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  45. ^ Warren L, Manos PD, Ahfeldt T, Loh YH, Li H, Lau F; et al. (2010). "Reprogramación altamente eficiente para pluripotencia y diferenciación dirigida de células humanas con ARNm sintético modificado". Cell Stem Cell . 7 (5): 618–30. doi :10.1016/j.stem.2010.08.012. PMC 3656821 . PMID  20888316. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  46. ^ Kutz, Erin (4 de octubre de 2010). "ModeRNA, una startup furtiva respaldada por Flagship, revela una nueva forma de producir células madre". Xconomy, Inc.
  47. ^ Hasty J, Pradines J, Dolnik M, Collins JJ (2000). "Interruptores y amplificadores basados ​​en ruido para la expresión génica". Proc Natl Acad Sci USA . 97 (5): 2075–80. arXiv : physics/0003105 . Bibcode :2000PNAS...97.2075H. doi : 10.1073/pnas.040411297 . PMC 15756 . PMID  10681449. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  48. ^ Isaacs FJ, Hasty J, Cantor CR, Collins JJ (2003). "Predicción y medición de un módulo genético autorregulador". Proc Natl Acad Sci USA . 100 (13): 7714–9. Bibcode :2003PNAS..100.7714I. doi : 10.1073/pnas.1332628100 . PMC 164653 . PMID  12808135. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  49. ^ Blake WJ, KAErn M, Cantor CR, Collins JJ (2003). "Ruido en la expresión génica eucariota". Nature . 422 (6932): 633–7. Bibcode :2003Natur.422..633B. doi :10.1038/nature01546. PMID  12687005. S2CID  4347106.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  50. ^ Blake WJ, Balázsi G, Kohanski MA, Isaacs FJ, Murphy KF, Kuang Y; et al. (2006). "Consecuencias fenotípicas del ruido transcripcional mediado por el promotor". Mol Cell . 24 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2006.11.003 . PMID  17189188.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  51. ^ Ellis T, Wang X, Collins JJ (2009). "Construcción basada en la diversidad y guiada por modelos de redes de genes sintéticos con funciones predichas". Nat Biotechnol . 27 (5): 465–71. doi :10.1038/nbt.1536. PMC 2680460 . PMID  19377462. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  52. ^ Guido NJ, Wang X, Adalsteinsson D, McMillen D, Hasty J, Cantor CR; et al. (2006). "Un enfoque de abajo hacia arriba para la regulación genética". Nature . 439 (7078): 856–60. Bibcode :2006Natur.439..856G. doi :10.1038/nature04473. PMID  16482159. S2CID  4418558.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  53. ^ Yeung MK, Tegnér J, Collins JJ (2002). "Ingeniería inversa de redes genéticas mediante descomposición en valores singulares y regresión robusta". Proc Natl Acad Sci USA . 99 (9): 6163–8. Bibcode :2002PNAS...99.6163Y. doi : 10.1073/pnas.092576199 . PMC 122920 . PMID  11983907. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  54. ^ Gardner, TS; di Bernardo D; Lorenz D; Collins JJ (4 de julio de 2003). "Inferir redes genéticas e identificar compuestos de acción mediante perfiles de expresión". Science . 301 (5629): 102–105. doi :10.1126/science.1081900. PMID  12843395. S2CID  8356492.
  55. ^ Kohanski, MA; Dwyer DJ; Hayete B; Lawrence CA; Collins JJ. (2007). "Un mecanismo común de muerte celular inducida por antibióticos bactericidas". Cell . 130 (5): 797–810. doi : 10.1016/j.cell.2007.06.049 . PMID  17803904. S2CID  1103795.
  56. ^ Kohanski MA, Dwyer DJ, Wierzbowski J, Cottarel G, Collins JJ (2008). "La traducción incorrecta de las proteínas de membrana y la activación del sistema de dos componentes desencadenan la muerte celular mediada por antibióticos". Cell . 135 (4): 679–90. doi :10.1016/j.cell.2008.09.038. PMC 2684502 . PMID  19013277. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  57. ^ Allison KR, Brynildsen MP, Collins JJ (2011). "Erradicación de bacterias persistentes mediante metabolitos mediante aminoglucósidos". Nature . 473 (7346): 216–20. Bibcode :2011Natur.473..216A. doi :10.1038/nature10069. PMC 3145328 . PMID  21562562. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  58. ^ Kohanski, MA; DePristo, MA; Collins, JJ. (2010). "El tratamiento con antibióticos subletales conduce a resistencia a múltiples fármacos a través de mutagénesis inducida por radicales". Molecular Cell . 37 (3): 311–320. doi :10.1016/j.molcel.2010.01.003. PMC 2840266 . PMID  20159551. 
  59. ^ Lee, HH; Molla MN; Cantor CR; Collins JJ. (2010). "El trabajo de caridad bacteriana conduce a una resistencia a escala poblacional". Nature . 467 (7311): 82–85. Bibcode :2010Natur.467...82L. doi :10.1038/nature09354. PMC 2936489 . PMID  20811456. 
  60. ^ Stokes, Jonathan M.; Yang, Kevin; Swanson, Kyle; Jin, Wengong; Cubillos-Ruiz, Andres; Donghia, Nina M.; MacNair, Craig R.; French, Shawn; Carfrae, Lindsey A.; Bloom-Ackermann, Zohar; Tran, Victoria M. (20 de febrero de 2020). "Un enfoque de aprendizaje profundo para el descubrimiento de antibióticos". Cell . 180 (4): 688–702.e13. doi : 10.1016/j.cell.2020.01.021 . ISSN  1097-4172. PMC 8349178 . PMID  32084340. 
  61. ^ "Jim Collins recibe financiación para aprovechar la IA en el descubrimiento de fármacos". Noticias del MIT | Instituto Tecnológico de Massachusetts . 23 de abril de 2020 . Consultado el 13 de noviembre de 2020 .
  62. ^ Collins JJ (1994). "Caminar al azar mientras se está de pie en silencio". Phys Rev Lett . 73 (5): 764–767. Bibcode :1994PhRvL..73..764C. doi :10.1103/PhysRevLett.73.764. PMID  10057531.
  63. ^ Collins JJ, Chow CC, Imhoff TT (1995). "Resonancia estocástica sin ajuste". Nature . 376 (6537): 236–8. Código Bibliográfico :1995Natur.376..236C. doi :10.1038/376236a0. PMID  7617033. S2CID  4314968.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  64. ^ Collins JJ, Imhoff TT, Grigg P (1996). "Transmisión de información mejorada por ruido en mecanorreceptores cutáneos SA1 de ratas mediante resonancia estocástica aperiódica". J Neurophysiol . 76 (1): 642–5. doi :10.1152/jn.1996.76.1.642. PMID  8836253.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  65. ^ Collins JJ, Imhoff TT, Grigg P (1996). "Sensación táctil potenciada por el ruido". Nature . 383 (6603): 770. Bibcode :1996Natur.383..770C. doi : 10.1038/383770a0 . PMID  8893000. S2CID  3660648.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  66. ^ Priplata, A; Niemi J; Harry J; Lipsitz LA; Collins JJ (4 de octubre de 2003). "Plantillas vibratorias y control del equilibrio en personas mayores". The Lancet . 362 (9390): 1123–1124. doi :10.1016/S0140-6736(03)14470-4. PMID  14550702. S2CID  33216209.
  67. ^ "1999 Young Innovator, James Collins". Technology Review. Noviembre-diciembre de 1999. Consultado el 15 de abril de 2007 .
  68. ^ "Scientific American 50: ganadores y colaboradores de SA 50". Scientific American. 21 de noviembre de 2005. Consultado el 15 de abril de 2007 .
  69. ^ "MacArthur Fellows, octubre de 2003". Fundación John D. y Catherine T. MacArthur. Archivado desde el original el 16 de octubre de 2007. Consultado el 15 de abril de 2007 .
  70. ^ Tucker, Ian (21 de mayo de 2011). «James Collins: Una cucharada de azúcar ayuda a que la medicina baje». The Guardian . ISSN  0261-3077 . Consultado el 22 de abril de 2024 .
  71. ^ Shaner, Karen (13 de abril de 2016). «James Collins nombrado investigador distinguido Allen 2016». MIT News . Instituto Tecnológico de Massachusetts . Consultado el 19 de diciembre de 2023 .
  72. ^ Brick, Tricia (primavera de 2006). "Genius at Work". Bostonia . págs. 20–25. Archivado desde el original el 19 de octubre de 2012 . Consultado el 12 de junio de 2009 .
  73. ^ "James J. Collins nombrado laureado con mención honorífica". Harvard-MIT Health Sciences and Technology . 22 de septiembre de 2023 . Consultado el 19 de diciembre de 2023 .
  74. ^ "Atención sanitaria y ciencias de la vida: James Collins". Irish America . 5 de octubre de 2022 . Consultado el 19 de diciembre de 2023 .
  75. ^ "Duke Senior se lanza hacia grandes premios". Duke Today . 19 de octubre de 2023. Archivado desde el original el 25 de junio de 2020 . Consultado el 29 de septiembre de 2024 . {{cite web}}: Verificar |url=valor ( ayuda )

Referencias adicionales

Enlaces externos