Wilmer Velásquez es el máximo goleador del fútbol hondureño de todos los tiempos con 198 goles.
En ese entonces; este club, era dirigido por el técnico argentino Ricardo Antonio Lavolpe quien protestó a la directiva la contratación de Velásquez.
A su regreso con el Olimpia, Velásquez anotó su gol número 100 el 31 de octubre del 2001 ante la Universidad.
Posteriormente en el juego de ida de la gran final ante el Club Deportivo Platense, el ‘Matador' se hizo presente en el marcador, ayudando a su equipo a ganar un nuevo título nacional.
En enero del 2009, Wilmer Velásquez reveló que el Clausura 2008-2009 sería su última competencia como futbolista activo.
En esta eliminatoria, el ‘Matador' se hizo presente en el marcador anotándole goles a Guatemala, México, Surinam y Canadá.
Después de esta participación con la selección mayor, pasaron varios años, sin que el ‘Matador’ integrara el combinado nacional.
En ese torneo; Velásquez fue pieza fundamental junto a Milton Núñez en la delantera, para que Honduras llegara a disputar el título contra la selección de fútbol de Costa Rica.
Después de lograr la clasificación, Wilmer Velásquez también participó con la selección nacional en la Copa Oro del 2005.
Para Velásquez este torneo de la Copa Oro, fue la revancha; ya que después de tres participaciones éste, finalmente se hizo presente en el marcador, anotándole goles a Colombia y a Costa Rica en los partidos que Honduras les venció por 2-1 y 3-2 respectivamente.
Wilmer Velásquez marcó cuatro de los nueve goles; lo que fue suficiente para que el ‘Matador,’ se adjudicara su tercer título de goleo, en ese torneo clasificatorio centroamericano.