La tripulación de vuelo estuvo integrada por los salvadoreños Capitán Cesare Edoardo D'Antonio Mena (40) y el Primer Oficial Juan Rodolfo Artero Arévalo (26).

El avión al parecer duró dos horas sobrevolando el aeropuerto Toncontín, la investigación hecha por Aeronáutica Civil de El Salvador y expertos entendidos en la materia concluyeron que un error de procedimiento del piloto (quien hizo dos intentos fallidos de aterrizaje) ocasionaron que el avión se deslizara y estrellara, debido a que la aeronave tocó suelo pasando la mitad de la pista, acortando así la distancia necesaria para el frenado.

Hubo 6 personas fallecidas: el presidente del Banco Centroamericano de Integración Económica (BCIE) Harry Brautigam (por paro cardiorrespiratorio), Fidel Zurita Cuadros, Jeanne Chantal Neele (esposa de Brian Michael Fraser Neele, embajador brasileño en Honduras quien resultó herido en el accidente), el piloto capitán Césare Edoardo D'Antonio Mena, y un taxista con su pasajero en uno de los tres autos accidentados.

[2]​ El presidente de Honduras ordenó cerrar el Aeropuerto Internacional Toncontín para operaciones aéreas internacionales, por lo que las aerolíneas Continental Airlines, American Airlines, Copa Airlines, entre otras, tuvieron que utilizar el Aeropuerto Internacional Ramón Villeda Morales de San Pedro Sula, Honduras que se ubica a 270 kilómetros de Tegucigalpa.

Meses más tarde el aeropuerto fue reabierto para vuelos internacionales debido a la presión de diversos sectores nacionales que se oponían al cierre del aeropuerto porque se debía a las presiones de la aerolínea propietaria del avión, la que desde el inicio (y hasta la fecha) culpa al aeropuerto del accidente y no reconocen que hubo errores del piloto al desconocer procedimientos de aproximación a la pista en condiciones climáticas desfavorables.