Ese mismo año, el 25 de noviembre, fallece el pontífice Lucio III, y ese mismo día es elegido papa, siendo consagrado el 1 de diciembre.
Con este matrimonio el papado pierde el apoyo que como estado vasallo de la Santa Sede recibía del Reino de Sicilia, y además, pasa a verse amenazado también desde el sur por el imperio germánico.
Ante esta ofensa, el papa excomulga al patriarca y a los obispos que intervinieron en la ceremonia, y nombra como arzobispo de Tréveris al candidato vetado por el emperador, quien en respuesta hace que su hijo Enrique ocupe los Estados Pontificios.
El papa amenaza al emperador con la excomunión, pero finalmente, ante la falta de apoyo de los obispos alemanes, se vio obligado a ceder en la reunión mantenida en Gelnhausen.
Las profecías de San Malaquías se refieren a este papa como Sus in cribo (El cerdo por la criba), cita que hace referencia a su apellido, (crivelli = “criba”), y a que en su escudo de armas aparece un cerdo.