En 1998 da inicio la licenciatura en Médico Cirujano y se inicia la construcción del edificio que albergaría el área e la salud que actualmente contempla las licenciaturas en: Cirujano Dentista, Nutrición, Psicología y Ciencias de la familia.
En 2006 obtiene el Premio Yucatán a la Calidad 2005, en el rubro de Educación, que otorga el Instituto Yucateco para la Calidad y la Innovación (INYCC) del Gobierno del Estado de Yucatán.
Se convierte en la primera institución educativa privada en obtener la sede y llevar al cabo el máximo evento deportivo estudiantil: la Universiada Nacional 2006.
En años más recientes, la universidad inauguró un nuevo campus que incluye espacios educativos y deportivos, fortaleciendo sus recursos e infraestructura.
Además, ha enfatizado su compromiso con la investigación y la colaboración internacional, promoviendo la participación activa de sus estudiantes en proyectos interdisciplinarios.