Fue nombrada en honor del precursor de la independencia peruana José Faustino Sánchez Carrión.

En 1963 se abre una nueva Facultad, la de Ciencias económicas y comerciales, contando ésta con presupuesto propio.

Según la mitología inca, en la costa central del imperio incaico, en la que actualmente se ubica la ciudad de Huacho, había un dios llamado Pachacámac o Pacha Kamaq (en quechua: Soberano del mundo), considerado como el creador en las culturas Lima, Chancay, Ychsma y Wari.

Su representación histórica y mitológica ha sido considerada por las autoridades universitarias para ser incluida en el logo de la Universidad.

Depende jerárquicamente del Vicerrectorado Académico y está a cargo de una comisión de seis docentes, un graduado y dos estudiantes fiscalizadores, nombrados por el Consejo Universitario a propuesta del Rector.

Este examen puede ser rendido por quienes hayan ocupado los Primeros Puestos del Nivel Secundario, titulados y/o graduados, traslado interno, traslado externo, deportistas calificados, personas con discapacidad y las instituciones del Convenios Camay y ashaninka.

Los profesores que enseñan en el centro pre son elegidos mediante concurso elaborado en la propia universidad.

Del total de 92 universidades licenciadas en el Perú,[6]​ la Universidad Nacional José Faustino Sánchez Carrión se ha ubicado regularmente dentro del tercio inferior a nivel nacional en determinados rankings universitarios internacionales.