Toma su nombre del lugar donde se encuentra San Lorenzo Tezonco, el pueblo originario de Iztapalapa.
El nombre Tetzon-co significa: "Tezontli" que significa tezontle y "co" que significa en o dónde, "en donde se da el tezontle" o "donde hay tezontle" y representa el contorno de una calavera, debido a que al lado de la estación se encuentra el Panteón Civil de San Lorenzo Tezonco.
El día 3 de mayo de 2021, aproximadamente a las 22:22 h., se registró un derrumbe en la intersección con la estación Olivos, en donde colapsaron una de las trabes y dos vagones del convoy que se encontraba circulando.
Se reportaron alrededor de 80 lesionados y 27 fallecidos como cifra oficial.
La Jefa de Gobierno Claudia Sheinbaum se trasladó al lugar del accidente, y se evaluó la magnitud del incidente para comenzar con los trabajos de remoción de los vagones del tren y los escombros de la estructura vencida.