El sistema se puede pagar con efectivo o con la Tarjeta de Movilidad Integrada.

Una vez creado el organismo, ya con una personalidad jurídica y patrimonio propios, se comenzó a reordenar la prestación y la imagen del servicio.

En el año 2002, fueron entregadas 155 autobuses Mercedes-Benz Marcopolo Torino, mientras que en el 2004 se incorporaron 103 nuevos autobuses también de la marca Mercedes-Benz Marcopolo Torino.

El último banderazo de unidades del Servicio Ordinario se dio en el 2006, se incorporaron 240 autobuses nuevos y 35 rehabilitados; estos últimos, como resultado de desarrollos tecnológicos para incorporar mejoras tanto técnicas como ecológicas, a autobuses que a pesar de su antigüedad, todavía pueden ser considerados como operables y con un buen estado de funcionamiento.

En 2008 se adquirieron 33 autobuses para la operación de RTP en Metrobús, 12 de los cuales son autobuses biarticulados para 240 pasajeros, los primeros en su tipo en México.

[4]​[5]​[6]​ A las unidades entre los modelos 2006 y 2009 les serán instalados filtros con el fin de reducir sus emisiones contaminantes.

Como parte de esta renovación los modelos del 2001 a 2002 fueron chatarrizados y renovados con autobuses nuevos Euro 5 (solo pocas unidades en buen estado se conservaron para servicio ordinario,así como otros que fueron reconvertidos a unidades de servicios generales para mantenimiento y provisiones en Modulos Operativos y cierres de circuito).

[4]​ El cambio se hizo principalmente debido a que las autoridades se habían encontrado con un sistema rezagado, donde más del 60% de las unidades estaban fuera de circulación.

[13]​ El Servicio Expreso es una modalidad en la que el autobús solo se detiene en una serie de paradas previamente establecidas con mayor lejanía entre las habituales, con el fin de que la ruta sea más rápida.

[14]​ Los motores de estos autobuses cumplen la normatividad ambiental EPA 04.

[17]​ Este servicio se ofrece a través de 30 autobuses Hyundai Súper Aero City, cuyo corredor principal es la Av.

Está denominada como "Ruta Verde", ya que cuenta con modernas unidades Hyundai que operan con Gas Natural Comprimido, un combustible menos contaminante; mismo que reduce el humo al 100%, el monóxido de carbono en un 99% y el óxido de nitrógeno al 50%.

Dichos autobuses estaban pintados de rosa y están rotulados con la leyenda “Servicio Exclusivo para Mujeres”.

Debido a la falta de unidades, este servicio fue disuelto y sus operadoras transferidas a las rutas que aún hoy en día son atendidas por hombres El Servicio Escolar brinda con 105 autobuses escolares equipados con cinturones de seguridad en la totalidad de sus asientos, interiores debidamente sonorizados y climatizados, asientos acojinados, pantallas con cápsulas informativas y educativas entre otros avances.