En 1780 se había rebelado en Perú el indígena Túpac Amaru II, que pretendía expulsar a las autoridades españolas y tomar el control de la región.
Un ejército español al mando de José del Valle ingresó a Puno el 26 de mayo logrando salvar la ciudad pero ordenó pronto abandonar la región al ser imposible mantenerla y se retiraron a Cuzco.
Esta ciudad tenía fuertes defensas que había mandando a construir Segurola cuando era Corregidor de esa provincia.
[3] La tropa de soldados logró defender la región de Sorata durante un tiempo, los indígenas no podían tomar la ciudad y tampoco lograron sitiarla por los repetidos ataques que Pinedo realizaba contra los rebeldes.
Esta situación se mantuvo hasta que llegó a la región Andrés Túpac Amaru quien tomó el mando de las fuerzas indígenas quechuas, le acompañaba Gregoria Apaza, hermana de Túpac Katari, y con quien mantenía una relación amorosa.
[2] Sorata quedaba al mando del comandante Manuel Santalla quien hizo lo posible para defender su posición y evitar la caída de la ciudad.
El sitio se prolongó y los indígenas vieron que necesitaban más hombres para tomar la ciudad.
En cuanto las aguas bajaron Andrés Túpac Amaru ordenó atacar la ciudad que quedaba prácticamente indefensa, muchas casas fueron saqueadas e incendiadas, varios españoles y criollos fueron asesinados en las calles.