Es la especie de orangután más numerosa, con unos cuarenta y cinco mil individuos en estado salvaje, números que contrastan con los siete mil quinientos orangutanes de Sumatra que aún viven en su hábitat natural.Esto ocurrió poco antes de que las dos islas, Borneo y Sumatra, se separaran.Las dos especies de orangután están más distantemente relacionadas que el chimpancé común y el bonobo.El número total de orangutanes de Borneo se estima ser menor del 14 % de lo que fue en un pasado reciente (desde hace diez mil años hasta la mitad del siglo XX) y este fuerte descenso se ha producido sobre todo durante las últimas décadas, debido a las actividades humanas y el desarrollo.[6] Esta opinión es apoyada también por el Programa de las Naciones Unidas para el Medio Ambiente, que establece en su informe que debido a la tala ilegal, el fuego y el amplio desarrollo del aceite de palma en las plantaciones, los orangutanes están en peligro de extinción, y si continúa la tendencia actual, se extinguirán.